结论：即使对方微信是用别人的手机注册的，且转账也是通过该微信进行，你仍然有可能起诉对方，但关键在于能否证明该微信的实际使用人是债务人本人，以及转账行为与债务人之间的关联性。
分析说明：
微信账号的归属与实际使用：
- 微信账号虽然注册在他人名下，但实际使用人可能是债务人。在这种情况下，如果能通过聊天记录、转账记录、证人证言等证据证明该微信账号的实际使用人是债务人，那么该微信账号的转账行为就可以视为债务人的行为。
- 例如，如果债务人经常通过该微信与你沟通借款事宜，并在借款后通过该微信接收你的转账，那么这些聊天记录和转账记录就可以作为证明债务人身份和借款事实的证据。
转账行为的关联性：
- 除了证明微信账号的实际使用人是债务人外，还需要证明转账行为与债务人之间的关联性。即，转账是否是为了履行借款合同或偿还债务。
- 如果转账记录中明确注明了借款金额、借款期限、利息等借款合同的主要条款，或者债务人在转账后承认了借款事实，那么这些转账记录就可以作为证明借款关系的直接证据。
起诉的法律依据与流程：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉需要满足一定的条件，包括原告是与本案有直接利害关系的公民、法人或其他组织，有明确的被告，有具体的诉讼请求和事实、理由，以及属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
- 在满足起诉条件的情况下，你可以向人民法院提起诉讼，要求债务人偿还借款本金及利息（如有约定）。法院将根据双方提供的证据和法律规定进行审理，并作出判决。
行动建议：
收集证据：
- 尽可能收集与借款相关的所有证据，包括聊天记录、转账记录、证人证言等。这些证据将有助于证明借款事实、债务人身份以及转账行为的关联性。
咨询律师：
- 在起诉前，建议你咨询专业律师（比如我），了解具体的法律程序和诉讼风险。律师将根据你的具体情况提供法律建议，并帮助你准备起诉材料。
提起诉讼：
- 在收集到足够证据并咨询律师后，你可以向人民法院提起诉讼。在起诉过程中，你需要按照法院的要求提交起诉材料，并参加庭审等诉讼活动。
特殊场景：
- 如果债务人否认微信账号的实际使用人是其本人，或者否认转账行为与借款之间的关联性，那么你需要提供更多的证据来证明你的主张。例如，你可以申请法院调取微信账号的注册信息、登录记录等，以证明该微信账号的实际使用人是债务人；或者提供其他间接证据来证明转账行为与借款之间的关联性。
法律后果：
- 如果法院最终认定借款事实成立，并判决债务人偿还借款本金及利息（如有约定），那么债务人需要履行判决义务。如果债务人拒不履行判决义务，你可以向法院申请强制执行，通过法律手段追回借款。
在处理此类债务债权纠纷时，务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。