结论：在老板非法集资诈骗自首并交代与会计无关的情况下，经侦部门仍可能会依法对会计人员进行询问，以全面调查案件事实。以下是对此问题的详细分析：

一、经侦询问会计人员的法律依据

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在侦查刑事案件时，有权对与案件有关的人员进行询问，以收集证据、查明事实。在非法集资诈骗案件中，会计人员作为公司财务记录的直接操作者，其掌握的财务信息对于案件的侦破和定性具有至关重要的作用。因此，即使老板已经自首并交代与会计无关，经侦部门仍有权依法对会计人员进行询问。

二、经侦询问会计人员的可能内容

1. 财务记录的真实性：经侦部门可能会询问会计人员关于公司财务记录的真实性，包括账目是否清晰、是否存在虚假记录或隐瞒收入等情况。

2. 资金流向：会计人员需要说明公司资金的流入和流出情况，特别是与非法集资活动相关的资金流动，如投资者的资金是否进入公司账户、资金是否被用于非法活动等。

3. 老板的指示：经侦部门可能会询问会计人员是否接到过老板关于非法集资活动的指示或要求，以及会计人员是如何执行这些指示的。

4. 个人行为：如果会计人员存在个人行为，如私自挪用资金、参与非法集资活动等，经侦部门也会进行询问并调查相关情况。

三、会计人员的权利与义务

1. 权利：

   • 如实陈述：会计人员有权如实陈述自己所知道的事实，不受任何胁迫或诱导。
   • 保护隐私：在询问过程中，会计人员的个人隐私应得到保护，经侦部门不得泄露其个人信息或询问与案件无关的内容。

2. 义务：

   • 配合调查：会计人员有义务配合经侦部门的调查工作，提供必要的财务信息和资料。
   • 不得隐瞒或伪造证据：会计人员不得隐瞒或伪造与案件有关的证据，否则将承担相应的法律责任。

四、可能面临的法律后果

1. 如果会计人员确实不知情：如果会计人员确实不知道老板的非法集资活动，且没有参与其中，那么其通常不会承担刑事责任。但需要注意的是，如果会计人员存在疏忽大意或未尽到合理的审查义务，导致公司财务记录存在重大问题，可能会面临一定的行政处罚或民事责任。

2. 如果会计人员知情并参与：如果会计人员知道老板的非法集资活动并参与其中，如协助伪造财务记录、隐瞒资金流向等，那么其将构成共犯，需要承担相应的刑事责任。

五、建议与措施

1. 保持冷静与配合：如果会计人员被经侦部门询问，应保持冷静并积极配合调查工作，如实陈述自己所知道的事实。

2. 寻求法律帮助：如果会计人员对询问过程或内容存在疑问或担忧，可以寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。

3. 保留证据：会计人员应保留好与案件相关的财务记录和资料，以备不时之需。

作为孙衡律师，我专注于刑事辩护和婚姻家庭领域。如果您在非法集资诈骗案件或其他刑事案件中遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。