结论前置：办理房产证时购房合同被收走是否合法，需根据具体情况判断。一般来说，若因办理贷款或房产证备案等正常流程需要，购房合同被银行或房管局暂时留存是合理的；但若开发商无正当理由收走合同，则可能涉及违法。
一、购房合同被合法收走的常见情形
银行贷款抵押情况：
- 若购房者通过贷款方式购买房屋，银行在办理贷款时通常会要求收走购房合同原件，以确保自身债权的安全。这是银行业务流程中的正常操作，购房者无需过分担心。待贷款还清并办理解押手续时，部分银行可能会将合同原件返还给购房者。
房管局备案存档：
- 在办理房产证的过程中，购房合同需要提交给房产管理部门进行备案。部分地区的房管局在办理完毕后可能会暂时留存购房合同原件进行存档，以规范房屋交易档案管理。然而，这并不意味着房管局会永久性收走合同，通常情况下，房管局会在完成存档手续后将合同原件返还给购房者或提供副本供其使用。
二、购房合同被非法收走的情形及应对措施
开发商不合理收走：
- 若开发商无正当理由收走购房合同，购房者应首先与其沟通要求返还，并保留书面沟通记录。若协商无果，可向房地产管理部门投诉，或通过法律途径解决，包括提起诉讼要求返还合同及赔偿损失。
应对措施：
- 沟通与查询：购房者应主动与收走合同的一方进行沟通，了解其收走合同的具体原因和用途。同时，也可以查询是否有合同的备份或电子版存在。
- 留存证据：在合同被收走之前，购房者应自行留存好合同的复印件或拍照、录像留存相关证据。这些证据在后续维权过程中将发挥重要作用。
- 法律途径：若沟通无果或认为存在问题，购房者有权向法院提起诉讼，要求返还合同或提供法律救济。在诉讼过程中，购房者需提供充分证据支持自己的主张。
三、购房合同的重要性及保管建议
购房合同的重要性：
- 购房合同明确了房屋的基本信息、价格、付款方式、交付时间等关键条款，是保护购房者和开发商双方权益的重要法律依据。因此，无论是对于购房者还是开发商，妥善保管购房合同都至关重要。
保管建议：
- 购房者应妥善保管好购房合同原件或官方认可的副本，以备不时之需。在办理房产证、贷款、过户等手续时，购房合同都是必不可少的法律文件。
- 若购房合同遗失或损毁，购房者应及时与开发商联系请求协助补办，或向房产管理部门咨询申请补办或查询备案合同的相关信息。
四、实际案例与法律分析
- 案例一：购房者通过贷款购房，银行收走购房合同作为抵押备案资料。购房者在贷款还清后，向银行申请返还合同原件，银行予以返还。此案例中，银行收走合同是合法且合理的。
- 案例二：开发商在办理完房产证后，无正当理由收走购房合同。购房者与开发商沟通无果后，向法院提起诉讼要求返还合同。法院经审理认为，开发商的行为侵犯了购房者的合法权益，判决开发商返还合同并赔偿损失。此案例中，开发商的行为构成违法。
总结：办理房产证时购房合同被收走是否合法，需根据具体情况判断。购房者应了解购房合同的重要性，并妥善保管好合同原件或副本。若遇到合同被非法收走的情况，应积极采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。