首先，即便妹妹的户口已经注销，且目前不知去向，法院仍然会依法处理遗产诉讼。接下来，我会详细解释法院可能的处理方式及你应当如何应对。

1. 法院的处理方式：

   • 确认当事人身份：法院会首先确认所有涉及遗产继承的当事人的身份，包括已经注销户口的妹妹。虽然户口注销，但她的继承权并不因此自动丧失。
   • 公告送达：如果妹妹的确切下落不明，法院可能会采取公告送达的方式，即在指定的媒体或法院公告栏上发布通知，要求妹妹在一定期限内出现或提出答辩。
   • 缺席审判：如果公告期满后，妹妹仍未出现，法院有权进行缺席审判，即根据已有证据和事实，依法对遗产进行分配。

2. 你的应对方式：

   • 提供妹妹的相关信息：尽管妹妹下落不明，但你应尽可能向法院提供她的基本信息，如姓名、身份证号、最后已知的住址等，以便法院进行身份确认和后续处理。
   • 积极配合法院调查：在遗产诉讼过程中，你可能需要配合法院进行财产调查、证据收集等工作。请务必如实提供相关信息，以免影响诉讼的公正性和效率。
   • 关注诉讼进展：保持与法院的沟通，及时了解诉讼进展和可能的结果。如有需要，你可以向法院申请延长公告期限或提供其他必要的协助。

总之，尽管妹妹的户口已经注销且下落不明，但法院仍然会依法处理遗产诉讼。你应积极配合法院的工作，提供必要的信息和协助，以确保诉讼的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。