帮助企业办理排污许可证这一行为本身并不违法，但关键在于办理的方式和过程中是否遵循了相关法律法规的规定。

首先，需要明确的是，排污许可登记是法定义务，且办理过程是不收取任何费用的。生态环境部门从未授权或委托任何第三方机构或个人有偿代办排污许可证，也未开发任何收费的微信程序或类似服务。因此，如果有人或机构声称可以“有偿代办”排污许可证，并以此收取费用，那么这种行为很可能是违法的，甚至可能是诈骗行为。

其次，企业或个人在办理排污许可证时，应该通过正规的渠道进行，如全国排污许可证管理信息平台。这个平台提供了详细的操作流程和指南，企业可以自行填报、提交登记信息，无需任何中介服务。如果企业或个人在办理过程中遇到困难或疑问，可以向当地生态环境部门寻求帮助或指导，而不是寻求有偿代办服务。

此外，从生态环境部公布的典型案例中也可以看出，排污许可领域存在多种违法行为，如以欺骗手段申请取得排污许可证、擅自改变管理类别无证排污、未依法重新申请取得排污许可证等。这些行为都受到了严厉的打击和处罚。因此，无论是企业还是个人，在办理排污许可证时都必须严格遵守相关法律法规的规定，确保申请材料的真实性和准确性。

综上所述，帮助企业办理排污许可证本身并不违法，但必须确保办理过程合法合规，不通过非法渠道或方式办理，也不参与任何有偿代办行为。如果企业或个人在办理过程中遇到任何疑问或困难，建议直接向当地生态环境部门咨询或寻求帮助。