在拆迁补偿协议由被告后妈持有，导致你无法取得的情况下，法院在特定条件下是会进行调查的。以下是对此问题的详细分析：
法院调查的条件与程序
申请调查取证：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。
- 在你的情况下，如果拆迁补偿协议由被告后妈持有，且你无法通过其他途径获取该协议，你可以向法院提出申请，请求法院调查取证。
法院调查的范围：
- 法院调查的范围通常限于与案件事实直接相关的证据。在你的案例中，拆迁补偿协议作为关键证据，直接关系到你的拆迁补偿权益，因此属于法院调查的范围。
法院调查的方式：
- 法院可能会通过向被告后妈发出调查令、传唤其到庭作证，或者直接前往相关部门、机构调取拆迁补偿协议等方式进行调查。
实际操作中的注意事项
提供线索与证据：
- 在向法院申请调查取证时，你应尽可能提供拆迁补偿协议可能存在的线索，如协议签订的时间、地点、参与人员等，以便法院更有效地进行调查。
- 同时，你也可以提供其他相关证据，如拆迁公告、补偿标准文件等，以支持你的主张。
配合法院调查：
- 在法院进行调查时，你应积极配合，提供必要的协助。例如，如果法院需要你提供进一步的线索或信息，你应及时提供。
法律后果与权益保护：
- 如果法院成功调取到拆迁补偿协议，且该协议确实涉及你的拆迁补偿权益，那么你可以根据协议内容主张你的权益。
- 如果被告后妈拒绝提供拆迁补偿协议或存在其他妨碍诉讼的行为，法院可能会对其采取相应的法律措施，如罚款、拘留等，以保障你的合法权益。
特殊情况下的处理
- 如果拆迁补偿协议确实由被告后妈持有，但她拒绝交出且法院调查无果，你还可以考虑通过其他途径解决纠纷。例如，你可以与拆迁方协商重新签订补偿协议，或者通过行政复议、行政诉讼等方式维护你的权益。
建议：如果你面临此类情况，建议及时向法院提出申请，请求法院调查取证。同时，你也可以咨询我，获取更具体的法律建议和指导。在处理此类纠纷时，保持冷静、理性，依法维护自己的合法权益。