结论：两个月未休息擅自休息后被辞退是否有补偿，需根据具体情况判断。若用人单位存在未安排休息日且未支付加班费等违法行为，劳动者擅自休息虽可能违反规章制度，但用人单位以此为由辞退劳动者可能构成违法解除，劳动者有权要求赔偿；若用人单位规章制度合法且已明确告知劳动者，劳动者擅自休息严重违反规章制度，用人单位辞退则可能无需支付补偿。

分析说明：

1. 用人单位存在违法行为的情况：

   • 根据《劳动法》及相关规定，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日，并依法支付加班费。若用人单位未安排劳动者休息日且未支付加班费，劳动者擅自休息虽可能违反了用人单位的规章制度，但用人单位以此为由辞退劳动者，可能构成违法解除劳动合同。
   • 在此情况下，劳动者有权要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金，赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍。经济补偿金根据劳动者在用人单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

2. 用人单位规章制度合法且已告知劳动者的情况：

   • 若用人单位的规章制度合法有效，且已明确告知劳动者擅自休息将视为严重违反规章制度，用人单位有权据此辞退劳动者，且无需支付经济补偿。
   • 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读并了解用人单位的规章制度，确保自己的行为符合规定。若因个人原因擅自休息，且该行为被用人单位规章制度明确禁止，劳动者应承担相应的后果。

特殊场景：

• 若劳动者擅自休息的行为并未对用人单位造成重大损失，且用人单位在辞退劳动者前未给予劳动者改正的机会或未进行充分的沟通，劳动者可以主张用人单位的辞退行为过于严厉，要求用人单位支付一定的经济补偿或寻求其他法律救济。

行动建议：

• 劳动者：在遇到此类情况时，应首先了解自己的权益和用人单位的规章制度。若认为用人单位的辞退行为违法或不合理，可以收集相关证据，如工资条、考勤记录、规章制度等，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
• 用人单位：应确保规章制度的合法性和合理性，并明确告知劳动者。在辞退劳动者前，应给予劳动者改正的机会或进行充分的沟通，避免因辞退行为引发劳动争议。

法律依据：

• 《劳动法》第三十八条：用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
• 《劳动合同法》第四十七条、第八十七条：关于经济补偿金和违法解除劳动合同赔偿金的规定。

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