商家因丢失市场监督管理局抽检封存样品，将面临行政处罚，具体处罚措施需结合丢失原因、情节严重程度及商家主观过错等因素综合判定。以下从法律责任、处罚依据及可能处罚措施等角度展开分析：

一、法律责任定性：商家行为涉嫌妨碍行政执法

市场监督管理局抽检封存的样品属于行政执法证据，商家负有妥善保管义务。根据《中华人民共和国行政处罚法》第五十六条，行政机关在收集证据时，可以采取抽样取证的方法；在证据可能灭失或者以后难以取得的情况下，经行政机关负责人批准，可以先行登记保存，并应当在七日内及时作出处理决定。商家擅自丢失封存样品，可能被认定为“拒绝、阻挠监督检查”或“隐匿、转移、变卖、损毁被查封、扣押的财物”，需承担行政法律责任。

二、处罚依据：以《食品安全法》《产品质量法》为核心

1. 若抽检涉及食品安全：
   根据《中华人民共和国食品安全法》第一百一十四条，食品生产经营者拒绝、阻挠、干涉监督检查的，由县级以上人民政府食品安全监督管理部门责令停产停业，并处二千元以上五万元以下罚款；情节严重的，吊销许可证；构成违反治安管理行为的，由公安机关依法给予治安管理处罚。
   关键情节：若商家因故意或重大过失导致样品丢失（如未按规定存放、擅自拆封等），可能被认定为“阻挠监督检查”，直接适用上述条款。

2. 若抽检涉及产品质量：
   根据《中华人民共和国产品质量法》第五十六条，拒绝接受依法进行的产品质量监督检查的，给予警告，责令改正；拒不改正的，责令停业整顿；情节特别严重的，吊销营业执照。
   关键情节：若商家因管理疏忽导致样品丢失（如保管不善、未尽到注意义务），可能被认定为“拒绝接受检查”的间接情形，需承担警告、责令改正等较轻责任。

三、可能处罚措施：结合情节轻重分层处理

1. 一般情节（过失丢失）：

   • 行政机关可能责令商家限期改正，并给予警告；
     
   • 若商家能证明已尽到合理保管义务（如因不可抗力、第三方原因等导致丢失），可能免除或减轻处罚。

2. 严重情节（故意丢失或造成重大影响）：

   • 罚款：根据《食品安全法》或《产品质量法》，罚款幅度为二千元至五万元（食品安全领域）或警告至吊销营业执照（产品质量领域）；
     
   • 停产停业：若丢失样品导致无法完成抽检程序，可能被责令暂停相关生产经营活动；
     
   • 信用惩戒：处罚信息将纳入企业信用记录，影响商家资质审核、政府采购等。

四、商家应对建议

1. 立即补救：第一时间向市场监督管理局报告样品丢失情况，说明原因并配合重新抽检；
   
2. 固定证据：保留样品丢失的现场照片、监控录像、保管记录等，证明已尽到合理义务；
   
3. 主动整改：完善内部管理制度，明确样品保管责任人及流程，避免再次发生类似事件。

提示：具体处罚需由市场监督管理局根据调查结果认定，商家如对处罚决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有进一步疑问，可直接向我咨询。