有营业执照的员工被辞退的赔偿问题，需根据辞退的合法性分情况讨论：

1. 合法辞退（员工存在法定过错）
   若员工存在《劳动合同法》第39条规定的情形（如严重违反规章制度、严重失职造成重大损失、被依法追究刑事责任等），用人单位可合法解除劳动合同，无需支付经济补偿。此时营业执照的存在不影响赔偿结果，但用人单位需承担举证责任，证明辞退的合法性。

2. 违法辞退（无法定理由或程序违法）
   若用人单位无法定理由或未履行法定程序（如未提前30日通知、未支付代通知金等）辞退员工，则构成违法解除。此时员工可主张赔偿金，标准为经济补偿金的2倍。经济补偿金按工作年限计算，每满1年支付1个月工资，6个月以上不满1年按1年计算，不满6个月支付半个月工资。
   示例：员工工作3年，月工资5000元，违法辞退赔偿金为：5000×3×2=30000元。

3. 协商一致解除劳动合同
   若双方协商一致解除，用人单位需支付经济补偿金（标准同上）。若员工主动提出解除，则无补偿，但用人单位存在未及时支付劳动报酬、未依法缴纳社保等过错时，员工可主张补偿。

4. 特殊情形：营业执照与劳动关系认定
   若员工持有营业执照但与用人单位存在实际劳动关系（如个体工商户经营者雇佣亲属），仍需按劳动关系处理辞退赔偿。若员工同时是用人单位的股东或合伙人，则可能涉及股权或合伙关系，需结合《公司法》或《合伙企业法》处理，此时营业执照可能影响责任主体认定，但不影响辞退赔偿的基本逻辑。

关键提醒：

• 赔偿金额以员工离职前12个月的平均工资为基数（含奖金、津贴等），但高于当地社平工资3倍的，按3倍封顶计算。
  
• 若用人单位未签订书面劳动合同，员工可主张双倍工资差额（最多11个月），但与辞退赔偿是独立诉求。
  
• 员工应保留工资条、考勤记录、辞退通知等证据，以便维权。
  

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