村委会签订合同、经济合作社付款的行为是否有效，需分情况讨论，核心判断标准在于村委会的签约行为是否具备合法授权，以及经济合作社的付款行为是否符合其职责范围或合同约定。具体分析如下：

1. 若村委会签订合同的行为有合法授权，且经济合作社付款符合合同约定或职责范围，则行为有效
   根据《民法典》第一百六十一条、第一百六十二条，村委会作为基层群众性自治组织，若经村民会议或村民代表会议授权（如授权签订经济类合同），或合同内容属于其法定职责范围（如集体资产经营管理），则其签订的合同对集体经济组织成员具有约束力。此时，经济合作社作为集体经济组织的一种形式，若合同明确约定由其履行付款义务，或其付款行为属于集体经济事务的常规操作（如支付集体采购款项），则付款行为有效，合同整体生效。

2. 若村委会签订合同的行为无合法授权，或经济合作社付款超出职责范围且未获追认，则行为可能无效
   若村委会未经村民会议或村民代表会议授权，擅自以集体名义签订合同（如超出集体资产处置权限），或合同内容违反法律强制性规定（如低价转让集体土地），则合同可能因“无权代理”或“违法”被认定无效。此时，经济合作社若未在合同中明确作为付款方，或其付款行为未获村民会议追认（如未经民主议定程序同意支付），则付款行为可能因“无合法依据”被要求返还，合同整体无效。

实务建议：

• 对村委会而言，签订合同前应严格履行民主议定程序（如召开村民会议或村民代表会议），并留存会议记录、授权文件等证据，避免因程序瑕疵导致合同无效。
  
• 对经济合作社而言，付款前应核实合同主体是否合法、付款条款是否明确，若合同签约方为村委会但约定由合作社付款，建议通过补充协议明确权利义务，避免纠纷。
  
• 若已发生纠纷，可依据《民法典》第一百五十四条（恶意串通）、第一百五十七条（民事法律行为无效后果）等条款，通过协商、调解或诉讼解决。
  

如有具体合同文本或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料提供更精准的分析。