施工总承包中设计和施工的招标代理费一般不可以由施工单位统一支付，但具体是否可行需依据招标文件、合同约定以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

从招标文件和合同约定角度

1. 若招标文件或合同明确规定：招标人在编制招标文件时，通常会明确各项费用的承担主体，包括招标代理费。如果招标文件或后续签订的合同中明确规定设计和施工的招标代理费由招标人（建设单位）承担，那么施工单位无需支付这部分费用。反之，如果招标文件或合同中明确约定由施工单位承担，那么施工单位则需要按照约定支付。
2. 若招标文件或合同未明确规定：在这种情况下，双方可能会产生争议。一般来说，招标代理费是招标人为了完成招标活动而支付的费用，从公平合理的角度出发，应由招标人承担。但具体还需结合实际情况，如双方在合同谈判过程中的协商结果等。

从法律法规角度

1. 《中华人民共和国招标投标法》及相关规定：该法律主要规范了招标投标活动的程序和要求，但并未直接规定招标代理费的承担主体。不过，根据法律的精神和原则，招标代理费作为招标活动的成本之一，通常应由招标人承担，除非双方另有约定。
2. 行业惯例和公平原则：在建设工程领域，招标代理费一般由招标人承担是行业惯例。这是因为招标人是招标活动的发起者和组织者，为了完成招标活动而聘请招标代理机构，因此应承担相应的费用。同时，从公平原则出发，施工单位作为投标人，参与投标活动并承担投标成本，不应再额外承担招标代理费。

实际操作建议

1. 仔细审查招标文件和合同：在参与投标前，施工单位应仔细审查招标文件和合同条款，明确招标代理费的承担主体。如果招标文件或合同中存在不明确或模糊的条款，应及时与招标人沟通并明确约定。
2. 协商解决争议：如果双方在招标代理费的承担问题上产生争议，应首先通过协商解决。协商过程中，双方可以依据招标文件、合同条款以及相关法律法规进行充分沟通，寻求合理的解决方案。
3. 寻求法律途径：如果协商无果，双方可以依据相关法律法规和合同条款，通过诉讼或仲裁等法律途径解决争议。

在实际操作中，建议你根据具体情况与招标人进行充分沟通并明确约定招标代理费的承担主体，以避免后续产生不必要的争议和纠纷。如果你在建设工程领域还有其他法律问题，欢迎直接向我咨询。