行政案件中扣押清单通常制作一式两份。以下是对此问题的详细分析：

法律基础与原则

根据《中华人民共和国行政强制法》第二十四条的规定，行政机关在实施查封、扣押时，应当制作并当场交付查封、扣押决定书和清单。这一规定确保了行政强制过程的透明度、合法性和可追溯性，从而有效保障当事人的合法权益。

清单份数的具体规定

1. 通常做法：

   • 在实践中，为了确保执法的透明性和公正性，查封、扣押清单通常会制作一式两份。其中一份由行政机关留存，作为执法记录的重要组成部分，用于后续可能的行政复议或行政诉讼中证明执法行为的合法性；另一份则交给当事人或其代理人，使他们能够清晰了解自己的财物被查封、扣押的具体情况，并在必要时作为维护自身权益的证据使用。

2. 法律依据：

   • 《中华人民共和国行政强制法》第二十四条明确规定：“查封、扣押清单一式二份，由当事人和行政机关分别保存。”这一条款直接回答了用户的问题，明确了扣押清单的份数及其保存方式。

灵活性与地方性规定

虽然《中华人民共和国行政强制法》对查封、扣押清单的份数做出了明确规定，但在实际操作中，也可能因不同的行政机关、具体的执法情况，以及地方性的特殊规定而有所差异。然而，这种灵活性并不改变清单份数的基本原则，即确保执法的透明性、公正性和合法性。在大多数情况下，一式两份的做法仍然是最普遍和标准的。

法律建议

对于面临查封、扣押情况的当事人来说，了解并遵守相关法律法规是至关重要的。如果当事人对扣押清单的份数或内容有疑问，应及时向行政机关提出询问或要求解释。同时，当事人也有权要求行政机关提供扣押清单的副本，以确保自己的权益不受侵害。如果当事人认为行政机关的执法行为存在违法或不当之处，可以通过行政复议或行政诉讼等途径来维护自己的合法权益。

综上所述，行政案件中扣押清单通常制作一式两份，这是由《中华人民共和国行政强制法》明确规定的。在实际操作中，虽然可能存在一定的灵活性，但一式两份的做法仍然是最普遍和标准的。如果当事人对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。