针对您提出的“起诉餐饮店后，其营业执照被注销了怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，餐饮店在注销营业执照前，需要完成一系列的准备工作和注销流程，这包括成立清算小组、整理资料、缴纳税款与清税申报、解除劳动合同以及处理租赁合同等。这些步骤的目的是确保餐饮店的财务和业务得到彻底清算，避免后续纠纷和风险。
针对您的情况，若餐饮店在您起诉后注销了营业执照，您可以采取以下措施：
确认注销的合法性：
- 您可以要求餐饮店（或其原负责人）提供注销营业执照的相关证明文件，如清算报告、注销登记申请书、清税证明等，以确认其注销行为的合法性。
- 若您怀疑注销行为存在违法或不当之处，如未进行彻底清算、未通知债权人等，您可以向当地市场监督管理部门（原工商行政管理部门）进行投诉或举报。
调整诉讼策略：
- 若餐饮店已注销，但其主体资格在注销前已存在，且您起诉的事项与其注销前的行为有关，您仍可以继续诉讼，但需将诉讼对象调整为餐饮店的原负责人或股东（若其需承担连带责任）。
- 在诉讼过程中，您需要提供证据证明餐饮店在注销前的行为给您造成了损失，并要求原负责人或股东承担相应的赔偿责任。
关注注销后的债权债务处理：
- 根据相关法律法规，餐饮店在注销前需成立清算小组，对债权债务进行清算。若清算小组未履行清算义务或清算不彻底，导致您无法获得应有的赔偿，您可以向清算小组成员（如股东、董事等）追究责任。
- 若餐饮店在注销时未依法进行清算，或存在恶意注销以逃避债务的情况，您还可以考虑通过法律途径追究其法律责任。
咨询专业人士：
- 由于注销流程复杂且涉及法律问题，建议您在处理此类事务时咨询专业律师或法律机构，以确保您的权益得到妥善维护。
额外建议：
- 在起诉前或诉讼过程中，若您发现餐饮店有注销营业执照的迹象或行为，应及时向法院申请财产保全或证据保全，以防止其转移财产或毁灭证据。
- 保留好所有与餐饮店交易的相关证据和文件，如合同、发票、付款记录等，以便在诉讼过程中提供有力的证据支持。
综上所述，虽然餐饮店注销了营业执照，但您仍可以通过调整诉讼策略、关注注销后的债权债务处理以及咨询专业人士等方式来维护自己的权益。希望以上解答能对您有所帮助。