医疗机构将从其他医疗机构正规渠道购买的药品进行二次销售，属于违法行为，将面临行政处罚，情节严重的可能涉及刑事犯罪。具体分析如下：

1. 行政处罚：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国药品管理法》的相关规定，药品经营企业必须按照国务院药品监督管理部门依据本法制定的《药品经营质量管理规范》经营药品。医疗机构并非药品经营企业，未经许可擅自从事药品销售活动，违反了药品管理法规。
   • 处罚措施：对于此类违法行为，药品监督管理部门有权责令关闭，没收违法销售的药物和违法所得，并处违法销售的药物货值金额十五倍以上三十倍以下的罚款；货值金额不足十万元的，按十万元计算。

2. 刑事犯罪：

   • 法律依据：若医疗机构的二次销售行为情节严重，如销售金额巨大、造成严重后果等，可能构成非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，违反国家规定，未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
   • 情节认定：在认定是否构成非法经营罪时，会综合考虑销售金额、违法所得数额、销售持续时间、对社会的影响等因素。

3. 其他法律后果：

   • 信誉损失：医疗机构的违法行为还会损害其信誉和形象，影响患者对其的信任度，进而可能影响其正常运营和发展。
   • 民事责任：如果因二次销售药品导致患者受到损害，医疗机构还可能面临民事赔偿责任。

建议：医疗机构应严格遵守药品管理法规，不得擅自从事药品销售活动。如有药品剩余或需要调剂，应通过合法途径进行，如与药品供应商协商退货、参与药品集中采购等。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。