关于“绩效奖金从工资里扣出来是否合法”的问题，结论前置如下：

1. 若劳动合同有明确约定，且公司规章制度合规，扣除行为合理且符合法律法规，则合法；
2. 若缺乏合同约定与制度依据，或考核与扣除不合理，或违反法律法规，则不合法。

合法情形分析

1. 劳动合同明确约定：

   • 用人单位与劳动者在劳动合同中应明确约定绩效奖金的相关条款，包括扣除标准、比例及条件等。这是合法扣除的前提和基础。
   • 例如，合同中可以约定：“若员工绩效未达到既定标准，用人单位有权按照约定比例扣除绩效奖金，但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。”

2. 员工认可相关规章制度：

   • 用人单位应依法制定并公示有关绩效奖金考核和扣除的规章制度。这些制度应经过民主程序制定，如通过职工代表大会讨论，并向劳动者公示告知。
   • 员工应知晓并通过实际工作行为（如参与绩效考核流程）表示对该制度的认可。当员工绩效不达标或违反相关制度时，用人单位可按照既定制度合理扣除绩效奖金。

3. 扣除后工资不低于最低工资标准：

   • 即使存在合同约定和制度依据，扣除绩效奖金后的工资也不得低于当地最低工资标准。这是法律对劳动者基本生活的保障，用人单位必须严格遵守。
   • 例如，若员工月工资为5000元，其中绩效奖金为1000元，若因绩效不达标扣除500元绩效奖金，则剩余工资为4500元，仍需确保不低于当地最低工资标准。

不合法情形分析

1. 缺乏合同约定与制度依据：

   • 若劳动合同中未约定绩效奖金扣除条款，且用人单位未制定并公示相关规章制度，则擅自扣除绩效奖金构成违法。
   • 例如，用人单位突然决定从员工工资中扣除绩效奖金，但既未在合同中约定，也未制定相关制度，这种行为是不合法的。

2. 不合理的考核与扣除：

   • 绩效考核制度不合理、不公正、不透明，或考核指标模糊、主观随意性大，导致扣除绩效奖金的行为缺乏合理性和公正性。
   • 扣除绩效奖金的比例过高，明显损害劳动者权益，或与实际工作表现不符。例如，员工仅因轻微失误就被扣除全部绩效奖金，这种行为是不合理的。

3. 违反法律法规的其他情形：

   • 如用人单位以欺诈、胁迫等手段迫使劳动者接受不合理的绩效奖金扣除条款。
   • 或用人单位未按照法定程序进行绩效考核和扣除，导致程序违法。例如，用人单位未提前告知员工绩效考核标准和扣除规则，就直接扣除绩效奖金。

应对措施与建议

若劳动者认为用人单位扣除绩效奖金的行为不合法，可采取以下措施维护自身权益：

• 首先与用人单位进行沟通协商，尝试解决争议。在沟通过程中，劳动者可以要求用人单位提供扣除绩效奖金的合同依据和制度依据，以及具体的考核标准和扣除比例。
• 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，并要求用人单位改正。
• 必要时，劳动者还可申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。劳动仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律法规进行裁决，确保劳动者的权益得到保障。

综上所述，绩效奖金的扣除行为是否合法需综合考虑多个因素。劳动者在面临此类问题时，应仔细审查劳动合同和公司规章制度，并咨询专业律师（如我）以获取准确的法律意见。