关于“盖项目部公章验收是否有法律效应”的问题，这并非一个可以一概而论的简单判断，而是需要根据具体情况来综合分析。
首先，我们要明确的是，项目部作为公司的一个临时机构，其印章的效力并不完全等同于公司公章。然而，在项目部的日常运作中，如果项目部印章被长期、正常地使用，并且这种使用得到了公司的默认或授权，那么该印章在特定情况下是可以代表公司或项目部的意志的。
具体到验收环节，如果验收单上仅加盖了项目部印章，我们需要考虑以下几个因素来判断其法律效力：
持章人的授权权限：如果加盖印章的人是项目负责人、授权委托人或表见代理人，并且他们有权代表项目部进行验收，那么该验收单在法律上通常是有效的。
印章的使用情况：如果项目部印章在其他对外经济往来或具有公示效力的场合已经被使用过，并且得到了公司的认可，那么该印章在验收单上的使用也更容易被认定为有效。
公司的态度：如果公司对项目部印章的使用有明确的规定，并且在实际操作中严格遵守这些规定，那么验收单的法律效力将更容易得到确认。反之，如果公司对项目部印章的使用管理混乱，或者对验收单上的印章提出异议，那么其法律效力就可能受到质疑。
以您提供的案例为例，虽然宜春市某公司辩称欠条中的项目部印章与其单位刻制备案的项目部印章完全不同，但法院最终认定，由于该印章在项目部运作过程中被长期正常使用，并且由授权委托人加盖，因此对外能代表该企业和项目部，对该企业和项目部均产生法律约束力。这一判决结果也体现了法院在认定项目部印章效力时的综合考量。
综上所述，盖项目部公章的验收单是否具有法律效力，并不能简单地根据印章本身来判断，而是需要综合考虑持章人的授权权限、印章的使用情况以及公司的态度等多个因素。因此，在实际操作中，建议您在使用项目部印章时严格遵守相关法律和公司规定，确保行为的合法性和有效性。如果遇到法律纠纷或疑问，建议及时咨询专业律师以获取更准确的法律意见。