客户因拿回扣被公司查处，核心结论取决于具体情节及公司制度，可能面临纪律处分、民事赔偿甚至刑事责任，需分情况处理：

1. 若公司仅依据内部制度查处，未涉及刑事报案

   • 纪律处分：公司可根据《劳动合同法》及内部规章制度，对员工进行警告、降职、解雇等处分。需注意公司制度需经民主程序制定并公示，否则处分可能被认定为违法解除劳动合同，员工可主张赔偿金。
     
   • 民事追偿：若回扣导致公司损失（如采购成本虚高），公司可依据《民法典》第1165条要求员工赔偿实际损失，需提供损失与回扣行为的因果关系证据（如采购合同、价格对比等）。
     

2. 若公司已向公安机关报案，涉嫌刑事犯罪

   • 非国家工作人员受贿罪：根据《刑法》第163条，员工利用职务便利索取或收受财物，为他人谋取利益，数额较大（6万元以上）的，处三年以下有期徒刑或拘役；数额巨大（100万元以上）的，处三年以上十年以下有期徒刑。
     
   • 对非国家工作人员行贿罪：若客户为谋取不正当利益，给予公司员工财物且数额较大（6万元以上），同样构成犯罪，处三年以下有期徒刑或拘役。
     
   • 刑事程序关键点：公安机关立案后，员工可能被采取刑事强制措施（如取保候审、拘留）；案件进入审查起诉阶段后，员工可委托律师阅卷、申请取保候审或争取从宽处理（如退赃、认罪认罚）。
     

3. 应对建议

   • 员工端：立即停止违法行为，主动退还回扣，配合公司调查；若已涉刑，尽快委托律师介入，争取从轻情节（如自首、立功）。
     
   • 公司端：完善内部反腐制度（如设立举报渠道、定期审计），发现线索后及时固定证据（如聊天记录、转账记录），必要时委托律师协助处理民事赔偿或刑事报案。
     

提示：回扣行为同时违反《反不正当竞争法》第7条，若涉及商业贿赂，公司可能面临行政处罚（如罚款、吊销营业执照），但此情形下员工仍需承担个人责任。具体处理需结合案件细节，如有疑问可直接向我咨询。