在建设工程合同被认定无效的情况下，并非所有条款都会随之失效，以下几类条款通常仍然具有法律效力：
争议解决条款继续有效
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百零七条的规定，合同不生效、无效、被撤销或者终止的，不影响合同中有关解决争议方法的条款的效力。这意味着，即使建设工程合同整体无效，合同中约定的仲裁条款、选择受诉法院的条款等争议解决方式仍然有效。例如，若合同中约定了“双方争议应提交至XX仲裁委员会进行仲裁”，则即便合同整体无效，此仲裁条款仍对双方具有约束力，双方需按此约定解决争议。
清理和结算条款的独立性
- 清理条款旨在清理债权债务关系，而结算条款则涉及合同款项的计算与支付。在建设工程合同中，即使合同无效，关于工程价款的结算条款通常仍然有效。例如，合同中约定“工程竣工后按实际完成工程量结算”，这一条款在合同无效后仍然可以作为双方结算工程价款的依据。这是因为，结算条款的履行并不依赖于合同的效力，而是基于实际发生的工程量等客观事实。
过错责任承担条款的有效性
- 如果合同中明确约定了在合同被认定无效时，有过错的一方应如何向对方承担赔偿责任，这类条款同样具有法律效力。例如，合同约定“因一方故意隐瞒重要事实导致合同无效，该方应赔偿对方全部损失”，当合同因此原因被认定无效时，无过错方有权依据此条款要求过错方赔偿。这有助于维护合同的公平性和诚实信用原则。
独立性条款与合法条款的保留
- 独立性条款：若合同中明确规定某一条款或部分内容独立于其他部分，则该部分可能不受合同其他部分无效的影响，继续保持其法律效力。例如，合同中可能约定“本合同的争议解决条款独立于其他条款，不受合同整体效力的影响”。
- 不违反法律法规的条款：合同中未违反任何法律法规且未损害他人利益的条款，即使合同整体无效，这些条款也可能被视为有效。例如，合同中关于工程质量的约定，如果符合相关法律法规和工程建设标准，即使合同无效，该约定仍然有效。
法律建议：
- 在签订建设工程合同时，双方应仔细审查对方的资质和合同条款，确保合同的合法性和有效性。特别是要注意合同中关于争议解决、清理结算、过错责任承担等关键条款的约定，以避免合同无效带来的法律风险和经济损失。
- 在施工过程中，双方应严格遵守相关法律法规和工程建设标准，确保工程质量和施工安全。如果发现合同存在无效情形，应及时协商解决或寻求法律途径维护自身权益。
可能后果：
- 如果建设工程合同被认定无效，且合同中没有有效的争议解决条款，双方可能面临争议解决困难的问题。这可能导致诉讼成本增加、解决周期延长等不利后果。
- 如果合同中没有有效的清理和结算条款，双方在合同无效后可能难以就工程价款等事项达成一致意见，从而引发新的纠纷。
因此，在签订和履行建设工程合同时，双方应高度重视合同条款的合法性和有效性问题，以维护自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。