当您发现自己的田地被人霸占，并且对方还持有土地证时，这确实是一个棘手的问题，但您可以通过以下步骤来维护自己的合法权益：
一、初步核实与沟通协商
核实土地证真伪：
- 首先，您需要仔细查看对方提供的土地证，确认其是否真实有效。
- 接着，您可以前往当地国土资源部门，查询该土地证的登记信息，以了解土地的真正权属情况。这一步至关重要，因为它能帮助您确认对方是否确实拥有该土地的合法权利。
沟通协商：
- 在确认对方土地证真实性的基础上，您可以尝试与对方进行沟通协商，寻求和平解决纠纷的途径。
- 如果直接沟通困难，您可以邀请村委会或当地调解组织介入，协助双方进行协商，以达成一个双方都能接受的解决方案。
二、法律途径维权
收集证据：
- 您需要收集能证明您对争议土地拥有合法权益的证据，如土地承包经营权证书、土地流转合同等。
- 同时，拍摄现场照片、视频，记录土地被侵占的具体情况，这些将作为您维权的重要证据。
- 如果可能的话，寻找证人证言，证明您一直使用该土地或对方存在侵权行为。
行政复议或行政诉讼：
- 如果您认为对方的土地证办理过程中存在违法违规行为，如提供虚假材料、程序不合法等，您可以向发证机关的上一级行政机关申请行政复议，请求撤销该土地证。
- 或者，您也可以直接向人民法院提起行政诉讼，要求法院对土地证的合法性进行审查，并作出相应判决。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明自己的主张。
民事侵权诉讼：
- 如果对方确实侵占了您的农田，即使其持有土地证，您也有权向法院提起民事诉讼。
- 在诉讼中，您可以要求对方停止侵害、排除妨碍、返还土地，并赔偿因侵占行为给您造成的损失。
三、其他注意事项
及时行动：
- 发现农田被侵占后，您应尽快采取行动，避免错过维权的最佳时机。时间拖得越久，可能越不利于您维护自己的权益。
咨询专业律师：
- 土地纠纷涉及的法律问题较为复杂，因此建议您咨询专业律师，获取更具体的法律意见和解决方案。律师将能够根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和指导。
保持冷静与理性：
- 在处理纠纷的过程中，您应保持冷静与理性，避免采取过激行为导致矛盾激化。通过合法途径来维护自己的权益，才是最明智的选择。
综上所述，面对田地被霸占且对方持有土地证的情况，您应通过初步核实与沟通协商、法律途径维权以及其他注意事项来维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。