当农民的土地被他人霸占时，可以采取以下步骤来维护自己的合法权益：

一、明确土地权属

首先，确认自己对土地的合法权益，包括土地的具体位置、面积、权属证明文件（如土地承包经营权证、宅基地使用证等）是否齐全。这是后续维权的基础。

二、保留证据

1. 收集直接证据：如土地被霸占的照片、视频等影像资料，以及可能的证人证言。
2. 保存间接证据：包括与霸占方相关的书面材料、通信记录等，这些可能作为后续维权的辅助证据。

三、协商解决

1. 尝试沟通：首先尝试与霸占方进行友好沟通，明确表达自己对土地的合法权益，要求其停止霸占行为并归还土地。
2. 邀请第三方调解：如双方对土地界限或权属存在争议，可邀请村委会、乡镇政府等中立第三方进行调解，寻求双方都能接受的解决方案。

四、申请政府处理或仲裁

1. 申请政府处理：若协商无果，农民可根据相关法律法规，依法向有管辖权的人民政府提出处理申请。政府将进行调查核实，并根据事实和相关法规作出处理决定。
2. 申请仲裁：如不愿协商、调解或协商、调解不成，农民也可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁。仲裁机构会根据双方提供的证据和法律法规，作出具有法律效力的裁决。

五、提起民事诉讼或报案

1. 提起民事诉讼：对于平等主体间的土地承包经营纠纷，农民可直接向人民法院提起民事诉讼。法院将依据双方提供的证据和法律规定进行审理，并作出判决。
2. 向公安机关报案：若霸占行为涉及违反治安管理处罚法甚至刑法的情况，如使用暴力手段霸占土地、故意破坏农作物等，农民应立即向公安机关报案。公安机关将依法进行调查处理，并对构成犯罪的依法追究刑事责任。

六、寻求法律援助

在整个维权过程中，农民如遇到法律难题或需要专业帮助，可寻求专业律师的法律援助，以确保自身权益得到充分保障。

七、遵守法律法规

在处理土地霸占问题时，农民应保持冷静和理智，遵守相关法律法规和政策规定，避免采取过激行为导致事态恶化。同时，也要注意在土地所有权和使用权争议解决前，不得改变土地利用现状。

综上所述，当农民的土地被他人霸占时，应通过保留证据、协商解决、申请政府处理或仲裁、提起民事诉讼或报案等途径来维护自身权益。在整个过程中，要遵守法律法规，保持冷静和理智，确保问题得到妥善解决。