结论：是否还会被查学生干部身份，主要取决于第三方协议的具体内容以及相关方的实际需求，一般情况下，单纯签订第三方协议并不会直接导致学生干部身份被查，但在某些特定情境下，可能会因协议内容或相关方要求而被涉及。以下从不同角度进行分析：

一、第三方协议的性质与内容

第三方协议，通常指的是由三方（如学生、学校、企业或其他机构）共同签订的协议，用于明确各方在特定事项上的权利和义务。这类协议的内容千差万别，可能涉及实习、就业、合作研究等多个方面。

1. 若协议内容与学生干部身份无关：

   • 在这种情况下，签订第三方协议通常不会触发对学生干部身份的审查。因为协议的重点在于其他事项，如实习安排、工作职责、薪酬待遇等，与学生干部的身份没有直接联系。

2. 若协议内容与学生干部身份有关：

   • 如果协议中明确提到了学生干部的身份，或者要求提供学生干部的相关证明，那么在签订协议的过程中或之后，相关方可能会对学生的干部身份进行核实。例如，某些企业可能更倾向于招聘具有学生干部经历的学生，因此在协议中可能会要求提供相关证明。

二、相关方的实际需求

除了协议内容外，相关方的实际需求也是决定是否会查学生干部身份的重要因素。

1. 企业或机构的需求：

   • 如果企业或机构在招聘或合作过程中，特别看重学生的组织能力、领导能力等，而这些能力往往与学生干部经历相关，那么他们可能会主动要求核实学生的干部身份。

2. 学校的需求：

   • 学校在组织学生参与某些活动或项目时，也可能需要了解学生的干部身份，以便更好地安排工作或分配任务。但这种情况通常发生在学校内部，与签订第三方协议的直接关联性不强。

三、法律建议与风险提示

1. 仔细阅读协议内容：

   • 在签订第三方协议前，务必仔细阅读协议条款，特别是那些涉及个人身份、权利义务的部分。如果协议中提到了学生干部身份，应明确了解相关方的要求和目的。

2. 保护个人隐私：

   • 如果协议中要求提供学生干部的相关证明或信息，应确保这些信息仅用于协议约定的目的，并防止被滥用或泄露。

3. 咨询法律专业人士：

   • 如果对协议内容或相关方的要求存在疑问，或者担心自己的权益受到侵害，可以及时咨询法律专业人士，如律师或法律顾问，以获取专业的法律意见和帮助。

总结来说，签订第三方协议本身并不会直接导致学生干部身份被查，但具体是否会被查取决于协议内容以及相关方的实际需求。因此，在签订协议前，应仔细阅读协议条款，了解相关方的要求和目的，并保护好自己的个人隐私和权益。如有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询。