结论前置：当公司的法人不是你，而实际经营人是你时，这涉及到公司治理结构中的权责划分问题，需要从法律、公司章程及实际运营三个角度来综合考量与处理。以下是对此问题的详细分析：
一、法律角度
法人代表的法律地位：
- 法人代表是公司法律上的代表，其对外代表公司行使职权，承担法律责任。法人代表的行为，在法律上视为公司的行为。
- 若你并非法人代表，但实际经营公司，需明确你与法人代表之间的法律关系，如是否为委托代理关系、是否构成表见代理等，以避免法律风险。
实际经营人的法律责任：
- 实际经营人虽非法律上的法人代表，但若其以公司名义进行经营活动，且公司或法人代表未明确表示反对，实际经营人可能需承担一定的法律责任。
- 若实际经营人的行为超出公司授权范围，或损害公司利益，可能需承担个人责任，甚至可能构成犯罪（如职务侵占罪等）。
二、公司章程角度
公司章程的约定：
- 公司章程是公司治理的基本文件，其中应明确公司的组织结构、职权划分等。若公司章程中已明确实际经营人的地位与职权，则应按章程执行。
- 若公司章程未明确，或实际经营情况与章程不符，建议及时修改公司章程，以明确各方权责。
股东会与董事会的决议：
- 股东会与董事会是公司的重要决策机构，其决议对公司具有约束力。若实际经营人的行为需经股东会或董事会批准，则应确保相关决议的合法性与有效性。
三、实际运营角度
明确权责划分：
- 为避免法律风险与内部纠纷，建议与法人代表签订书面协议，明确双方在公司经营中的权责划分、利益分配等。
- 协议中可约定实际经营人的权限范围、决策程序、监督机制等，以确保公司运营的规范性与稳定性。
完善内部管理：
- 建立健全公司内部管理制度，如财务管理制度、人事管理制度等，以规范实际经营人的行为。
- 定期对公司财务状况、经营成果进行审计与评估，以确保公司资产的保值增值。
考虑变更法人代表：
- 若实际经营人长期、稳定地经营公司，且得到股东会或董事会的认可，可考虑变更法人代表为实际经营人，以更准确地反映公司的实际治理结构。
- 变更法人代表需遵循公司章程与相关法律法规的规定，履行必要的程序与手续。
建议与提醒：在实际操作中，建议你与法人代表保持密切沟通，确保双方对公司经营的理解与期望一致。同时，建议你咨询专业律师（当然，你可以直接向我咨询，我擅长公司事务与股权转让领域），以获取更具体、更专业的法律建议。在涉及公司重大决策或法律纠纷时，务必谨慎行事，避免因个人行为给公司带来不必要的法律风险。