可以仅起诉主张解除补充协议，但具体能否实现解除目的，需结合以下角度分析：

一、合同相对性原则下的独立性

补充协议若与主合同具有可分性（如单独约定解除条件、履行期限、违约责任等），且未明确约定”补充协议解除导致主合同解除”的条款，则根据《民法典》第五百六十二条、第五百六十三条，当事人可单独就补充协议的解除条件成就时主张解除。例如：主合同约定工程总价及工期，补充协议单独约定”若发包方逾期支付进度款超30日，承包方有权解除补充协议”，此时承包方可仅就补充协议提起解除之诉。

二、解除条件成就的举证责任

主张解除方需证明：1. 补充协议约定的解除条件已成就（如逾期付款、质量不达标等）；2. 已按《民法典》第五百六十五条履行通知义务（直接起诉视为以诉讼方式通知）。若补充协议未约定通知程序，则法院可能直接审查条件是否成就后判决解除。

三、主合同效力的关联影响

需注意两种例外情形：1. 补充协议构成主合同核心条款（如主合同仅约定框架，补充协议明确标的、价款等实质内容），此时解除补充协议可能导致主合同目的无法实现，对方可能反诉要求解除主合同；2. 主合同约定”补充协议解除则主合同同步解除”，此时需一并主张解除主合同，否则可能因条款冲突被驳回。

四、实务操作建议

1. 起诉策略：在起诉状中明确诉讼请求为”解除XX合同之补充协议”，并围绕补充协议约定的解除条件组织证据（如付款记录、质量检测报告等）；2. 风险防范：若担心主合同关联影响，可同步申请法院对主合同履行情况（如已完工工程量、已付款比例）进行证据保全；3. 条款设计：未来签订补充协议时，建议明确约定”本协议解除不影响主合同其他条款效力”或”本协议解除导致主合同同步解除”等条款，以定分止争。

示例：若补充协议约定”发包方未按期支付安全文明施工费超15日，承包方有权解除补充协议”，而发包方确已逾期20日未支付，承包方仅起诉解除补充协议的诉求，法院一般会支持。但若主合同仅约定”按补充协议执行”，且补充协议解除后主合同无法履行，则发包方可能反诉要求解除主合同并索赔。

如有具体案情或补充协议文本，可进一步向我提供，我将结合条款细节分析解除可行性及风险点。