员工垫付社保是否适用诉讼时效法律规定，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若员工垫付社保后，与公司就报销或返还垫付款项产生争议，适用诉讼时效规定
   根据《民法典》第188条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为3年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算。例如：员工垫付社保后，多次向公司主张返还但被拒绝，或公司明确表示不履行义务，此时诉讼时效开始计算。若超过3年未起诉，公司可能以“诉讼时效抗辩”拒绝履行义务，员工将丧失胜诉权。

2. 若争议涉及社保缴纳的合法性（如公司未依法缴纳社保导致员工垫付），可能不直接适用诉讼时效，但需注意行政救济时效
   根据《劳动争议调解仲裁法》第27条，劳动争议申请仲裁的时效期间为1年，自当事人知道或应当知道权利被侵害之日起计算。但社保缴纳问题具有特殊性：

   • 若员工要求公司补缴社保（非返还垫付款），需通过劳动监察部门或社保征收机构处理，此时适用《社会保险法》第63条规定的行政处理程序，不直接受诉讼时效限制，但需在“知道或应当知道公司未缴纳社保”后合理期限内主张（实践中通常为2年内）。
     
   • 若员工垫付后，以“未依法缴纳社保”为由解除劳动合同并主张经济补偿，需在离职后1年内申请劳动仲裁，否则可能因超过时效被驳回。

关键提醒：

• 诉讼时效的“中断”规则：若员工在时效期间内通过书面催告、协商等方式主张权利，时效可重新计算。
  
• 证据保留：务必保存垫付凭证（如转账记录、社保缴费证明）、公司确认垫付的书面文件（如邮件、聊天记录）、主张权利的证据（如催款函、录音），以证明时效未过期。
  

建议：若涉及具体争议，建议携带材料详细沟通，以便进一步分析时效起算点及风险点。