结论：车辆合格证被他人损毁，您确实可以起诉，这主要依据的是《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定。

详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条：“行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。” 在此情况下，车辆合格证作为您的财产权益的一部分，被他人损毁，即构成了对您财产权益的侵害，您有权要求侵权人承担相应的法律责任。

2. 起诉条件：

   • 要起诉侵权人，您需要证明几个关键要素：一是您拥有车辆合格证的合法所有权或使用权；二是侵权人确实实施了损毁车辆合格证的行为；三是该行为给您造成了实际的损失或损害。这些证据可能包括购车合同、车辆合格证原件（如可能）、损毁现场的照片或视频、证人证言等。

3. 起诉流程：

   • 起诉前，建议您先尝试与侵权人进行协商，看是否能够达成和解或赔偿协议。如果协商无果，您可以向当地人民法院提起民事诉讼。在起诉时，您需要提交起诉状、相关证据材料以及缴纳诉讼费用。法院将依法审理案件，并根据事实和法律规定作出判决。

4. 可能的结果：

   • 如果法院认定侵权人确实存在过错并造成了您的损失，那么侵权人可能需要承担赔偿损失、恢复原状等民事责任。具体赔偿金额和方式将根据您的实际损失、侵权人的过错程度以及法院的判决来确定。

建议：

• 在处理此类纠纷时，建议您保持冷静和理性，尽量通过合法途径解决问题。
• 收集并保存好所有相关证据，以便在需要时提供证明。
• 如果对法律程序不熟悉或感到困惑，可以考虑咨询专业律师（比如我）以获取更具体的法律建议和帮助。

如果您在车辆合格证被损毁的问题上还有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。