结论：法院能否查封涉案房屋，关键在于房屋的权属状况及是否满足查封的法定条件。若房屋仍登记在被执行人名下或虽未登记但实际属于被执行人所有，且不存在其他不得查封的情形，法院通常可以查封；若房屋已通过合法方式转移至他人名下且不存在恶意逃避执行等情形，则法院一般不能查封。
分析说明：
房屋权属状况：
- 登记在被执行人名下：根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第二条，人民法院可以查封、扣押、冻结被执行人占有的动产、登记在被执行人名下的不动产、特定动产及其他财产权。因此，若房屋仍登记在被执行人名下，法院有权查封。
- 未登记但实际属于被执行人所有：若房屋虽未办理产权登记，但根据购房合同、付款凭证等证据能够证明房屋实际属于被执行人所有，且不存在其他权利人主张权利的情况，法院在查明事实后，也可以对该房屋进行查封。
是否存在不得查封的情形：
- 第三人善意取得：若房屋已通过合法买卖、赠与等方式转移至第三人名下，且第三人已支付合理对价并办理了产权登记，同时不存在恶意串通、逃避执行等情形，则第三人构成善意取得，法院不得查封该房屋。
- 其他法定不得查封的情形：如房屋属于被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，且符合《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》中关于不得查封的相关规定，法院也不得查封。
被告辩称的影响：
- 被告辩称房屋已归另案被执行人所有，这并不直接影响法院的查封决定。法院在作出查封决定前，会依法审查房屋的权属状况及是否存在不得查封的情形。若被告的辩称缺乏充分证据支持，或法院经审查认为房屋仍属于被执行人所有且不存在不得查封的情形，则法院有权查封该房屋。
行动建议：
- 若您是申请执行人：建议您收集并整理相关证据，如购房合同、付款凭证、产权登记证明等，以证明房屋的实际权属状况。同时，关注被告的辩称及提供的证据，及时向法院提出反驳意见。
- 若您是被告或房屋实际权利人：若您认为房屋不属于被执行人所有或存在不得查封的情形，建议您及时向法院提出执行异议，并提供充分证据支持您的主张。若法院裁定驳回您的异议，您还可以依法提起执行异议之诉以维护自身权益。
法律后果：
- 若法院查封了不应查封的房屋，您作为房屋实际权利人可以依法向法院提出执行异议之诉，要求法院撤销查封决定并赔偿因此造成的损失。
- 若您作为申请执行人，因未提供充分证据导致法院未能查封房屋或查封了不应查封的房屋，您可能需要承担因此产生的法律后果，如执行不能或赔偿损失等。
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