企业员工档案在自己手里确实可能影响退休，具体影响及应对措施如下：
一、可能产生的影响
退休审批受阻：
- 关键信息核实困难：在办理退休手续时，社保部门需要严格审核个人档案中的关键信息，如出生日期、参加工作时间、工作经历及特殊工种年限等。若档案由个人保管，社保部门可能难以判断档案的真实性和完整性，因为按规定档案应通过公对公方式传递和保管。个人保管过程中，档案可能被拆封或篡改，导致社保部门拒绝接收个人自带的档案进行审核，进而影响退休审批的进度和结果。
- 工龄认定问题：对于有视同缴费年限的参保人（如养老保险制度实施前在国企、集体企业工作的职工），档案是认定工龄的重要依据。若档案在个人手中出现问题，如材料缺失或损坏，可能导致无法准确认定工龄，进而影响养老金的计算和发放。
养老金待遇核算不准确：
- 特殊工种认定问题：从事特殊工种的人员可享受提前退休和养老金核算倾斜政策。档案中需详细记录特殊工种的工作岗位和时间。若档案在个人手中且记录不规范，可能影响特殊工种提前退休的办理和养老金待遇的核算。
- 职称评定材料缺失：具有专业技术职称的人员，其职称信息会影响养老金的核算。档案中应包含职称评定的相关材料。若个人保管不善导致材料丢失或损坏，可能使养老金待遇无法按相应职称标准核算。
违反档案管理规定：
- 根据《中华人民共和国档案法》的相关规定，档案应实行统一领导、分级管理，个人不得拒绝归档或据为己有。将档案放在自己手里不仅违反了法律法规，还可能因档案的真实性和完整性问题给自己带来不必要的法律风险和损失。
二、不产生影响的情况（相对较少）
- 仅存在实际缴费年限：对于无视同缴费年限且按时足额缴纳社保的参保人员，退休时主要依据社保系统中的缴费记录。这种情况下，档案对退休的影响较小，但部分地区仍可能要求提供档案进行简单审核。
- 灵活就业人员：以灵活就业人员身份参保的人员通常没有正式的人事档案或档案材料相对简单。退休时主要看社保缴费年限和缴费基数，档案影响不大。但即便如此，也建议将档案妥善保管或交由相关机构管理，以备不时之需。
三、应对措施与建议
尽快存档：
- 发现档案在自己手中后，应立即联系当地的人才交流中心、就业服务机构或原工作单位的档案管理部门，了解档案移交的具体流程和要求，并尽快将档案移交至指定的档案管理机构进行妥善保管。
档案审核与整理：
- 档案管理机构在接收档案后，会进行审核和整理，确保档案资料的真实性、完整性和规范性。个人应积极配合档案管理机构的工作，如发现档案存在问题，应及时补充和完善相关资料。
咨询与确认：
- 在办理退休手续前，建议提前咨询当地社保部门或档案管理机构，了解档案的具体要求和办理流程。确保档案的完整性和真实性得到有效保障，以便顺利办理退休手续和领取养老金。
总结来说，企业员工档案在自己手里确实可能对退休产生不利影响。为确保退休手续的顺利办理和养老金的正常领取，建议尽快将档案存放至合规机构，并密切关注相关政策动态和办理流程。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。