事业单位作为被告拒不出庭，确实会面临一定的法律责任和可能的违规后果，但不一定需要由纪委处理，具体取决于案件性质和情节严重程度。以下从不同角度进行分析：
一、法律责任与违规后果
缺席判决的风险：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。这意味着，如果事业单位作为被告拒不出庭，法院有权根据原告提供的证据和事实，直接作出对事业单位不利的判决。
对事业单位声誉的影响：
- 事业单位拒不出庭，可能被视为对法律程序的不尊重，对事业单位的声誉和形象造成负面影响。这可能影响事业单位在公众中的信任度，进而影响其正常运营和公共服务提供。
可能的行政责任：
- 如果事业单位的拒不出庭行为被认定为违反了相关行政法规或规章制度，事业单位及其相关责任人员可能面临行政处分，如警告、记过、降级等。这取决于具体案件的性质和情节严重程度，以及相关法律法规的规定。
二、是否需要由纪委处理
纪委的职责范围：
- 纪委主要负责监督党的组织和党员领导干部，查处违纪违法行为。如果事业单位的拒不出庭行为涉及违纪违法，且相关责任人员是党员领导干部，那么纪委有权介入调查并处理。
非党员领导干部的情况：
- 如果事业单位的拒不出庭行为不涉及违纪违法，或者相关责任人员不是党员领导干部，那么纪委通常不会直接介入处理。此时，可能由事业单位的主管部门或相关行政机关根据法律法规和规章制度进行调查和处理。
三、建议与措施
积极应诉：
- 事业单位作为被告，应当积极应诉，尊重法律程序，配合法院的审理工作。这有助于维护事业单位的合法权益，避免不必要的法律风险和声誉损失。
加强内部管理：
- 事业单位应当加强内部管理，建立健全的法律风险防控机制。这包括加强法律培训，提高员工的法律意识和法律素养；完善内部规章制度，明确法律责任和违规后果；加强监督和检查，确保各项规章制度得到有效执行。
寻求专业法律帮助：
- 如果事业单位在应对法律纠纷时遇到困难或问题，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和法律服务，帮助事业单位更好地应对法律纠纷，维护其合法权益。
如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和法律服务。