在违法建设案件中，若当事人不配合，证据收集确实会面临一定挑战，但仍有多种合法且有效的途径可以推进。以下是具体建议：

1. 行政机关依法调查取证
   根据《行政处罚法》及城乡规划相关法规，行政机关（如城管、规划部门）有权对违法建设进行调查。即使当事人不配合，行政机关仍可：

   • 现场勘验：对违法建设的位置、面积、结构等进行测量、拍照、录像，制作勘验笔录；
     
   • 调取资料：向自然资源、住建等部门调取涉案地块的规划许可、用地审批等文件，核实建设行为是否合法；
     
   • 询问第三方：对周边居民、物业、施工单位等进行询问，制作询问笔录，固定违法建设的事实；
     
   • 委托鉴定：对违法建设的安全性、影响等委托专业机构鉴定，形成鉴定意见。
     

2. 利用技术手段固定证据
   若当事人拒绝入内或阻挠勘验，可借助技术手段间接取证：

   • 无人机航拍：从空中拍摄违法建设的全景及细节，清晰展示其与周边环境的关系；
     
   • 卫星遥感影像：调取历史卫星图片，对比建设前后的变化，证明违法建设的形成时间及规模；
     
   • 公共视频监控：若违法建设位于公共区域或周边有监控，可申请调取录像，记录建设过程或当事人行为。
     

3. 证人证言与书面材料

   • 证人证言：寻找知情人员（如邻居、物业、施工人员）出具书面证言，描述违法建设的情况及当事人的行为；
     
   • 投诉举报材料：若其他居民曾投诉过该违法建设，可收集投诉记录、回复等材料，作为间接证据；
     
   • 公告送达：若需向当事人送达法律文书（如《责令停止建设通知书》），但当事人拒签，可依法公告送达，并留存公告记录。
     

4. 申请法院强制取证
   若行政机关已作出行政决定（如限期拆除），但当事人仍不配合且证据不足，可向法院申请强制执行。在执行过程中，法院可组织人员强制进入现场勘验、拍照、录像，甚至委托第三方拆除违法建设，过程中形成的材料可作为证据。

注意事项：

• 所有取证行为必须依法进行，避免侵犯当事人合法权益（如非法侵入住宅）；
  
• 证据需形成完整链条，从建设行为、违法性到当事人责任，均需有证据支撑； - 若证据收集困难，可考虑与当事人协商，通过书面承诺、录音等方式固定部分事实，但需谨慎操作，避免证据效力瑕疵。
  

若您在具体案件中遇到证据收集难题，可直接向我咨询，我会结合案件细节提供更针对性的建议。