被起诉并不直接影响办理港澳通行证的资格，但能否成功办理需结合具体案件情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
法律层面：被起诉本身不构成禁止性条件
根据《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》，办理港澳通行证的核心条件是：具有中国国籍、户籍、无刑事犯罪记录（针对特定情形）等。单纯被起诉（未定罪）不属于法律明确禁止办理的情形，因此理论上不影响申请资格。
实务层面：需结合案件性质与司法机关措施
- 若案件涉及限制出境措施：如法院因诉讼需要（如防止财产转移、逃避诉讼等）对当事人采取“限制出境”的司法措施，则当事人在此期间无法办理港澳通行证或使用通行证出境。此时需通过法院解除限制后才能正常申请。
- 若案件未涉及限制出境：即使被起诉，只要未被采取限制出境措施，仍可正常申请港澳通行证。但需注意，通行证审批由公安机关出入境管理部门负责，若案件涉及危害国家安全、社会公共利益等情形，公安机关可能根据个案情况综合判断是否批准。
操作建议
- 主动核实案件状态：若被起诉，可先通过法院或律师确认是否被采取限制出境措施。若未被限制，可正常提交申请；若被限制，需先解决诉讼问题（如提供担保、达成和解等）后再申请。
- 如实申报信息：在申请港澳通行证时，需填写个人涉诉情况。若隐瞒被起诉事实，可能面临行政处罚（如撤销通行证、罚款等），甚至影响后续诉讼程序。
总结：被起诉不直接剥夺办理港澳通行证的权利，但需结合案件是否涉及限制出境措施综合判断。如有具体案件情况，可进一步向我咨询，我会结合法律条文与实务经验为你详细分析。