农民专业合作社股金存单在合法设立且规范运营的合作社中是安全的、合法的，但若合作社存在违规操作或非法设立等情况，则可能存在风险与违法性。以下从合法性与安全性两个角度详细分析：

1. 合法性分析

   • 法律依据：根据《中华人民共和国农民专业合作社法》，农民专业合作社是依法登记的互助性经济组织，其成员可通过出资入股参与经营。股金存单本质是合作社与成员间的出资凭证，只要合作社依法设立并完成工商登记，股金存单即具有合法性。
     
   • 非法情形：若合作社未依法登记、超出经营范围吸收资金（如向非成员公开募股），或以股金名义变相吸收公众存款（涉嫌非法集资），则股金存单可能被认定为非法，相关行为可能触犯《刑法》第176条（非法吸收公众存款罪）。
     

2. 安全性分析

   • 规范运营的合作社：若合作社章程明确股金管理规则（如盈余分配、退股条件），且财务透明、定期审计，股金存单的安全性较高。成员权益受《农民专业合作社法》保护，合作社破产时成员股金可能优先于普通债权人受偿（但需以合作社剩余资产为限）。
     
   • 风险情形：
     
     • 管理混乱：若合作社未建立规范的财务制度，股金可能被挪用或滥用，导致成员损失；
       
     • 非法集资：若合作社以高息为诱饵吸收非成员资金，可能因资金链断裂无法兑付，甚至涉及刑事责任；
       
     • 市场风险：合作社经营亏损可能导致股金贬值，但此属商业风险，与合法性无关。
       

建议：

• 加入合作社前，核查其工商登记信息、章程及审计报告，确认是否合法设立；
  
• 避免参与“高息返利”“保底收益”等异常股金项目，此类可能涉嫌非法集资；
  
• 保留股金存单、出资凭证及合作社承诺文件，以便维权。
  

如有具体合作社或股金纠纷，可直接向我咨询，我将结合细节进一步分析。