结论：女婿偷拿丈母娘钱时间久了，是否还能查出来，这取决于多种因素，包括证据的保存情况、偷拿行为的性质以及法律程序的启动等。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、证据保存情况
直接证据：如果丈母娘或家庭成员在偷拿行为发生时或之后，及时保留了相关证据，如监控录像、目击者证言、被偷拿的钱款或物品等，那么这些直接证据将有助于证明女婿的偷拿行为。即使时间久了，只要这些证据保存完好，仍然有可能被用来查明事实。
间接证据：如果没有直接证据，但存在一些间接证据，如女婿近期经济状况的异常变化、与丈母娘关系的变化等，这些证据虽然不能直接证明偷拿行为，但可以结合其他证据形成证据链，增加查明事实的可能性。然而，间接证据的证明力相对较弱，需要更多的证据来支持。
二、偷拿行为的性质
盗窃行为：如果女婿的偷拿行为构成了盗窃罪，即秘密窃取他人财物，数额较大或多次盗窃的，那么丈母娘可以向公安机关报案，由公安机关进行调查取证。即使时间久了，只要公安机关认为有必要，仍然可以启动调查程序，并尝试查明事实。
家庭内部纠纷：如果女婿的偷拿行为并未构成犯罪，而是属于家庭内部的经济纠纷或矛盾，那么丈母娘可以选择通过家庭内部协商、调解或诉讼等方式来解决。在这种情况下，查明事实的难度可能相对较大，因为家庭内部的证据往往不如外部证据那么明确和可靠。
三、法律程序的启动
报案时间：如果丈母娘在发现偷拿行为后及时报案，那么公安机关将更容易展开调查，并收集相关证据。如果时间久了才报案，那么一些证据可能已经灭失或难以收集，从而增加查明事实的难度。
诉讼时效：对于涉及民事纠纷的偷拿行为，如果丈母娘选择通过诉讼来解决，那么需要注意诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。如果超过了诉讼时效期间，那么丈母娘可能失去胜诉权。然而，这并不意味着无法查明事实，只是可能无法通过法律程序来维护自己的权益。
四、建议与措施
及时保留证据：如果丈母娘发现女婿有偷拿行为，应尽快保留相关证据，如监控录像、目击者证言等。这些证据将有助于后续的法律程序。
及时报案或寻求调解：如果偷拿行为构成了犯罪或造成了较大的经济损失，丈母娘应及时向公安机关报案或寻求家庭调解、社区调解等途径来解决纠纷。
咨询专业律师：在处理此类问题时，丈母娘可以咨询专业律师的意见，了解自己的权益和可能的法律途径。律师将能够提供更具体和专业的建议。
最后，女婿偷拿丈母娘钱时间久了是否还能查出来，并没有一个确定的答案。它取决于证据的保存情况、偷拿行为的性质以及法律程序的启动等多种因素。因此，如果丈母娘遇到了此类问题，建议尽快采取行动，保留证据并咨询专业律师的意见。如果有任何法律问题，也可以直接向我咨询。