如果刑民交叉案件被法院当成民事案件判决后，您可以考虑以下几种途径来维护自己的合法权益：
申请再审：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以向上一级人民法院申请再审。
- 操作建议：您需要准备充分的证据材料，证明原判决在事实认定或法律适用上存在错误，特别是要突出案件中的刑事犯罪线索或事实，说明原判决未正确区分刑民责任，从而影响了判决的公正性。
向检察机关申请检察建议或抗诉：
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》和《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，检察机关有权对法院的审判活动进行法律监督，对于认为确有错误的判决、裁定，可以提出检察建议或抗诉。
- 操作建议：您可以向同级或上级检察机关提交书面申请，详细阐述原判决的问题所在，特别是刑事犯罪方面的线索和证据，请求检察机关依法履行监督职责。
刑事报案或控告：
- 法律依据：如果案件中确实存在刑事犯罪行为，且该行为对民事判决产生了实质性影响，您可以向公安机关报案或向检察机关控告，要求追究相关人员的刑事责任。
- 操作建议：在报案或控告时，您需要提供详细的犯罪线索和证据材料，以便公安机关或检察机关能够及时立案侦查。同时，您也可以说明原民事判决的问题，请求在刑事侦查过程中予以考虑。
另行提起刑事附带民事诉讼或单独提起民事诉讼（如适用）：
- 法律依据：在刑事犯罪行为得到确认后，您可以根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，在刑事诉讼过程中提起附带民事诉讼，要求犯罪嫌疑人赔偿因其犯罪行为给您造成的损失。如果刑事犯罪行为与原民事判决无直接关联，但您因该行为遭受了损失，您也可以单独提起民事诉讼。
- 操作建议：在提起诉讼前，您需要收集充分的证据材料，证明犯罪嫌疑人的犯罪行为与您的损失之间存在因果关系。同时，您也需要了解相关诉讼程序和法律规定，以便更好地维护自己的合法权益。
在处理此类案件时，您需要注意以下几点：
- 及时行动：一旦发现原判决存在问题或发现新的犯罪线索，您应尽快采取行动，以免错过申请再审、报案或控告的时效期限。
- 证据收集：无论是申请再审、向检察机关申请监督还是报案控告，您都需要提供充分的证据材料来支持自己的主张。因此，在处理案件过程中，您应注重证据的收集和保存。
- 法律咨询：由于刑民交叉案件涉及复杂的法律关系和程序问题，建议您在处理此类案件时咨询专业律师的意见。作为专注于经济犯罪、诈骗犯罪等领域的律师，我可以为您提供专业的法律咨询和辩护服务。
最后，我想强调的是，每个案件都有其独特性和复杂性，因此上述建议仅供参考。在实际操作中，您应根据案件的具体情况和法律规定来制定合适的维权策略。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。