市自然资源和规划局与法人、自然人签订的国家自然资源使用权合同，一般属于行政协议。以下从多个角度进行分析：

行政协议的定义与特征

行政协议，又称行政合同，是指行政机关为了实现行政管理或者公共服务目标，与公民、法人或者其他组织协商订立的具有行政法上权利义务内容的协议。其核心特征在于：

1. 主体特定：一方必须是行政机关，另一方是公民、法人或者其他组织。
2. 目的特定：为了实现行政管理或者公共服务目标。
3. 内容特定：协议内容具有行政法上的权利义务关系。

国家自然资源使用权合同的性质

国家自然资源使用权合同，通常涉及自然资源的出让、划拨等，这些行为往往与行政机关的行政管理职能紧密相关。具体来说：

1. 主体方面：市自然资源和规划局作为行政机关，具有签订行政协议的主体资格。
2. 目的方面：签订国家自然资源使用权合同，往往是为了实现自然资源的合理配置和有效利用，这符合行政管理的目标。
3. 内容方面：合同内容涉及自然资源的出让、划拨等，这些行为在行政法上具有明确的权利义务关系，如出让方（行政机关）有义务按照约定提供自然资源，受让方（法人或自然人）有义务按照约定使用自然资源并支付费用。

司法实践中的认定

在司法实践中，对于市自然资源和规划局与法人、自然人签订的国家自然资源使用权合同，法院通常会根据行政协议的定义和特征进行认定。如果合同内容符合行政协议的特征，且没有明确的民事合同性质，那么法院往往会将其认定为行政协议。

可能的例外情况

虽然国家自然资源使用权合同一般属于行政协议，但也存在例外情况。例如，如果合同内容主要涉及民事权利义务关系，且行政机关在合同中的地位并不突出，那么该合同可能被认定为民事合同。然而，这种情况在司法实践中相对较少见。

法律后果与救济途径

如果国家自然资源使用权合同被认定为行政协议，那么当事人之间的争议将通过行政诉讼途径解决。行政诉讼与民事诉讼在程序、证据规则、裁判标准等方面存在显著差异。因此，在签订和履行国家自然资源使用权合同时，当事人应当充分了解合同性质，以便在争议发生时选择正确的救济途径。

综上所述，市自然资源和规划局与法人、自然人签订的国家自然资源使用权合同，一般属于行政协议。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。