合作经营协议中如遇拆迁，房产的归属问题需根据协议的具体约定、房产的权属登记情况以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、协议有明确约定的情况
若协议明确约定拆迁时房产的归属：
- 归属合作方之一：如果合作经营协议中明确约定，在遇到拆迁时，房产归某一合作方所有，那么该约定具有法律效力，拆迁时房产应按照协议约定归该合作方。
- 归属合作双方共有或按比例分配：若协议约定拆迁时房产归合作双方共有，或者按照各自的投资比例、贡献比例等分配拆迁补偿，那么应按照协议约定执行。
协议约定需考虑的法律因素：
- 合法性：协议约定必须合法，不得违反法律法规的强制性规定，否则可能被认定为无效。
- 明确性：协议约定应明确具体，避免模糊不清，以免在拆迁时产生争议。
二、协议无明确约定的情况
房产登记在合作方名下：
- 若房产登记在某一合作方名下：在协议无明确约定的情况下，通常认为房产归该登记方所有。但拆迁时，其他合作方可能基于投资、贡献等因素主张权益，此时需通过协商、诉讼等方式解决。
- 登记方需证明房产来源：登记方需提供证据证明房产的合法来源，如购买合同、付款凭证等，以证明其所有权。
房产为合作经营期间共同购置或建造：
- 共同购置或建造的房产：若房产为合作经营期间共同购置或建造，且协议无明确约定归属，那么可能视为合作双方的共同财产。拆迁时，应按照各自的投资比例、贡献比例等分配拆迁补偿。
- 需评估各自贡献：在分配拆迁补偿时，需评估各自在购置或建造房产过程中的投资、贡献等因素，以确保公平合理。
三、相关法律法规的适用
《民法典》中关于物权的规定：
- 物权归属：根据《民法典》的规定，物权的归属应依据登记、合同等法律文件确定。在合作经营协议中，若涉及房产的物权归属，应明确约定并办理相关登记手续。
- 共有物权：若房产为合作双方共有，应明确各自的权利义务，包括拆迁时的补偿分配等。
拆迁补偿的相关规定：
- 补偿原则：拆迁补偿应遵循公平、合理的原则，确保被拆迁人的合法权益得到保障。
- 补偿方式：拆迁补偿方式包括货币补偿、房屋置换等，具体方式应根据拆迁政策、协议约定等因素确定。
四、建议与风险提示
- 明确协议约定：在签订合作经营协议时，应明确约定房产的归属、拆迁时的补偿分配等条款，以避免后续争议。
- 办理相关登记手续：若房产涉及物权变更或共有，应及时办理相关登记手续，以确保物权的合法性和有效性。
- 咨询专业律师：在遇到拆迁等复杂情况时，建议咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
若您在合作经营协议中遇到拆迁房产归属问题，或有其他房产纠纷、合同纠纷等法律问题，可直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。