结论：在法院判决中存在有贷款的房产，标注了代为还款但未标注代为结清的情况下，是否可以办理结清取决于多个因素，包括贷款合同的具体条款、法院判决的详细内容以及贷款银行或金融机构的政策等，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、贷款合同条款

1. 还款与结清的约定：首先，需要查看贷款合同中关于还款和结清的具体条款。如果合同中明确规定了还款和结清的条件、流程以及责任方，那么这些条款将作为判断是否可以办理结清的重要依据。
2. 代为还款与代为结清的区别：代为还款可能仅指某一方（如法院判决中的代为还款方）负责按照合同约定的时间和金额进行还款，而代为结清则可能涉及一次性还清剩余贷款本金和利息等更全面的义务。如果合同中未明确代为结清的条款，那么仅凭代为还款的标注可能不足以支持办理结清。

二、法院判决内容

1. 判决的具体表述：法院判决中的表述对于判断是否可以办理结清至关重要。如果判决中仅要求某一方代为还款，而未提及代为结清，那么这可能意味着该方仅承担还款责任，而不包括结清贷款的全部义务。
2. 判决的执行与履行：即使判决中未明确提及代为结清，但如果在实际执行过程中，代为还款方已经履行了全部还款义务，且贷款银行或金融机构同意结清贷款，那么在这种情况下，也是可以办理结清的。然而，这通常需要额外的协商和确认过程。

三、贷款银行或金融机构的政策

1. 结清政策：不同的贷款银行或金融机构可能有不同的结清政策。有些机构可能要求严格的合同条款和法院判决作为结清的依据，而有些机构则可能更加灵活，愿意根据实际情况进行协商和处理。
2. 协商与沟通：在尝试办理结清时，与贷款银行或金融机构的沟通和协商至关重要。通过解释法院判决的内容、展示还款记录以及表达结清的意愿，可能有助于促成结清的办理。

四、实际操作建议

1. 查阅贷款合同和法院判决：首先，仔细查阅贷款合同和法院判决的具体内容，明确还款和结清的条款以及各方的责任和义务。
2. 与贷款银行或金融机构沟通：其次，与贷款银行或金融机构进行沟通，了解其结清政策和要求，并询问是否可以基于当前的情况办理结清。
3. 寻求法律帮助：如果在实际操作过程中遇到困难或争议，建议寻求专业律师的法律帮助，以便更好地维护自己的权益。

最后，是否可以办理结清取决于多个因素的综合考量。如果有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。