集体合同里规定加班费按最低工资算，在多数情况下是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、不合法的情况
劳动合同或集体合同有明确约定更高工资：
- 如果劳动合同或集体合同中明确约定了劳动者的工资数额，且该数额高于当地最低工资标准，那么加班费应当以这些合同约定的工资作为计算基数。例如，若集体合同中约定月工资为6000元，则加班费应按6000元为基数进行计算，而非最低工资标准。
实际工资高于最低工资标准：
- 劳动者的实际工资，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等，如果高于最低工资标准，加班费也应基于实际工资计算。根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资组成，因此加班费的计算应涵盖这些部分。
法定加班费支付标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，工作日加班的加班费应不低于本人小时工资标准的1.5倍；休息日加班又不能安排补休的，加班费应不低于本人日或小时工资标准的2倍；法定节假日加班的，加班费应不低于本人日或小时工资标准的3倍。如果集体合同中规定的加班费计算基数低于这些标准，将违反法律规定。
二、合法的情况（较为罕见）
- 在特定情况下，如果劳动者的正常出勤工资就是当地最低工资标准，或者集体合同中明确约定加班费计算基数为最低工资标准，并且这些约定不违反法律、法规的强制性规定，同时也不低于法定的加班费支付标准（尽管实际上很难达到），那么这种计算方式可能是合法的。但这种情况非常特殊，且必须确保所有相关约定均符合法律法规的要求。
三、劳动者权益保护
- 如果单位未按照劳动者的实际工资或集体合同约定的工资支付加班费，而是错误地采用了最低工资标准，这将构成对劳动者合法权益的侵害。劳动者有权要求单位进行纠正，并按照实际工资或合同约定支付加班费。
- 如果单位拒绝改正，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉举报，或者通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。劳动监察部门将会对此类违法行为进行调查处理，确保劳动者的权益得到妥善保护。
四、建议
- 审查集体合同：劳动者应仔细审查集体合同中关于加班费的规定，确保自己的权益不受侵害。
- 保留证据：劳动者应保留好与工资、加班费相关的证据，如工资条、考勤记录等，以便在需要时提供证明。
- 及时维权：如果发现单位存在违法行为，劳动者应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
综上所述，集体合同里规定加班费按最低工资算在多数情况下是不合法的。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取法律手段来维护这些权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。