农村宅基地违法时，乡镇人民政府具有一定的执法权，但并非主要执法主体，其执法权主要体现在日常监督管理和对特定违法行为的制止与改正上。以下从多个角度详细分析：
一、主要执法主体
根据《中华人民共和国土地管理法》第七十八条的规定，农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府农业农村主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。这一规定明确了农业农村部门在宅基地违法行为查处中的主体地位，负责主要的执法工作，包括责令退还非法占用的土地和限期拆除新建房屋等。
二、乡镇人民政府的执法权
日常监督管理：乡镇人民政府在日常管理中对维护农村宅基地使用秩序起到重要作用。它们有责任对本辖区内的宅基地使用情况进行监督管理，及时发现并制止违法建设行为。
制止与改正：对于正在进行的违法建设行为，乡镇人民政府可以责令停止建设、限期改正。如果逾期不改正，乡镇人民政府还有权进行拆除。这一权力体现了乡镇人民政府在宅基地违法管理中的及时性和有效性，能够迅速响应并制止违法行为。
协同执法：虽然乡镇人民政府不是主要的执法主体，但在实际执法过程中，它们往往与县级以上人民政府农业农村主管部门、自然资源主管部门等密切配合，共同维护农村宅基地使用的合法性和秩序性。
三、执法权的限制与协作
执法权的限制：乡镇人民政府的执法权主要限于制止和改正正在进行的违法建设行为，以及日常的监督管理工作。对于已经完成的违法建设行为，如需要责令退还非法占用的土地或限期拆除新建房屋等，则主要由县级以上人民政府农业农村主管部门负责。
协作机制：在处理宅基地违法行为时，各相关部门应密切配合、协同作战。乡镇人民政府应充分发挥其贴近基层、反应迅速的优势，及时发现和制止违法行为；同时，县级以上人民政府农业农村主管部门和自然资源主管部门等也应根据其职责范围，积极参与到宅基地违法行为的查处工作中来。
四、实际案例与司法实践
在司法实践中，省内外法院系统、检察院系统在处理相关案件时，均认为农村村民违法占用土地（包括各类土地）建设住宅的行为应由农业农村部门查处。这一实践做法与法律规定和机构职能分工相一致，进一步强化了农业农村部门在宅基地违法行为查处中的主体地位。同时，乡镇人民政府在其中的协同作用也得到了广泛认可。
总结与建议：
农村宅基地违法时，乡镇人民政府具有一定的执法权，但主要限于日常监督管理和对特定违法行为的制止与改正上。对于更严重的违法行为，如非法占用土地建住宅等，则主要由县级以上人民政府农业农村主管部门负责查处。因此，在处理宅基地违法行为时，应明确各部门的职责分工，加强协作配合，共同维护农村宅基地使用的合法性和秩序性。如果您在宅基地方面遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。