持牌机构借贷复利在符合法律规定的情况下是合法的。以下是对这一问题的详细分析：
法律规定
根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》中的相关条款，虽然直接针对的是民间借贷，但持牌金融机构的借贷行为在利率设定上通常也需遵循类似的公平、合理原则，且其利率上限往往受到更为严格的监管。具体来说，对于民间借贷，借贷双方约定的利率未超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍的，受法律保护；超过部分的，则不受保护。对于持牌金融机构，虽然其利率设定可能不完全参照此标准，但过高的复利同样可能被视为不公平、不合理的合同条款，从而面临法律挑战。
复利的合法性条件
利率上限：持牌机构在设定复利时，必须确保利率水平在法律允许的范围内。如果复利计算后的实际利率超过了法律规定的上限，那么超出部分的利息将不受法律保护，借款人也有权拒绝支付。
合同条款：复利条款必须在借贷合同中明确约定，且不得存在欺诈、胁迫等情形。合同是双方意思表示一致的产物，如果复利条款是在不公平、不自愿的情况下签订的，那么该条款可能被视为无效。
透明度：持牌机构在提供借贷服务时，必须向借款人充分披露复利的计算方式、利率水平以及可能产生的费用等信息，确保借款人在充分了解的基础上做出决策。
法律后果
如果持牌机构违反了上述规定，设定了过高的复利或者未充分披露相关信息，那么可能面临以下法律后果：
合同条款无效：超出法律规定的复利部分可能被视为无效条款，借款人无需支付。
行政处罚：持牌机构可能因违反金融监管规定而受到行政处罚，如罚款、吊销牌照等。
民事赔偿：如果因复利问题给借款人造成了损失，持牌机构还可能需要承担民事赔偿责任。
建议
对于借款人而言，在签订借贷合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于复利的部分，确保自己充分了解并同意相关条款。如果对于复利计算方式或利率水平存在疑问，应及时向持牌机构咨询或寻求专业法律意见。
对于持牌机构而言，应严格遵守相关法律法规和监管要求，合理设定复利水平，并充分披露相关信息，以维护自身合法权益和金融市场秩序。
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