加班费确实适用诉讼时效，但具体规定因劳动关系是否存续而有所不同。以下是对加班费诉讼时效的详细解析：

一、劳动关系存续期间

在劳动关系存续期间，由于劳动者与用人单位之间持续存在权利义务关系，劳动者往往难以立即主张加班费。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬（包括加班费）发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制。这意味着，只要劳动关系未终止，劳动者可以随时向劳动仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付加班费。

二、劳动关系终止后

一旦劳动者与用人单位的劳动关系终止，劳动者就需要在劳动关系终止之日起一年内提出索要加班费的请求。这一规定确保了劳动者在劳动关系结束后仍有一段时间来主张自己的权益。如果超过这个期限，劳动者可能就无法再通过仲裁或诉讼途径来追索加班费了。

三、诉讼时效的中断与中止

在加班费诉讼时效期间内，还可能因法定事由而中断或中止。例如：

1. 中断：如果劳动者在时效期间内向用人单位主张过加班费，或者用人单位同意履行支付义务，那么仲裁时效将从中断时起重新计算。
2. 中止：因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。

四、实际操作中的注意事项

1. 举证责任：劳动者在主张加班费时，需承担举证责任，证明加班事实的真实性和存在性。因此，劳动者应妥善保留加班的相关证据，如考勤记录、加班通知、工资单等，以便在需要时提供有力的支持。
2. 及时维权：鉴于加班费诉讼时效的规定，劳动者应及时了解自己的权益状况，并在法定时效内采取行动。如果错过时效期间，劳动者的权益将难以得到有效维护。
3. 法律救济途径：如果劳动者对仲裁裁决不服，可以在收到裁决书之日起的十五日内向人民法院提起诉讼。这是劳动者维护自己合法权益的重要途径。

五、实际案例说明

以某公司拖欠员工加班费为例，若员工在劳动关系存续期间发现公司未支付加班费，可以随时向劳动仲裁委员会申请仲裁。若员工在劳动关系终止后才发现公司未支付加班费，则应在劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请（假设在此期间没有发生时效中断或中止的情形）。

综上所述，加班费确实适用诉讼时效，且具体规定因劳动关系是否存续而有所不同。劳动者在主张加班费时，应充分了解相关法律规定，并在法定时效内采取合适的行动，以确保自己的权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。