将劳务合同变更为合作协议让员工签字，其效力需分情况讨论，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、若员工自愿签署且协议内容合法
协议有效：如果员工在充分了解协议内容、权利义务及法律后果的基础上，自愿签署了合作协议，且该协议内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这份合作协议是有效的。此时，员工与用人单位之间的关系将按照合作协议的约定来确定，可能不再是劳务关系，而是合作关系或其他类型的关系。
法律后果：一旦协议生效，双方均需按照协议约定履行各自的义务。如果一方违反协议约定，另一方有权依据协议约定追究其违约责任。
二、若员工非自愿签署或协议内容违法
协议无效或可撤销：如果员工是在被欺诈、胁迫或乘人之危的情况下签署了合作协议，或者协议内容存在违法违规的情况（如违反劳动法律法规的强制性规定），那么这份合作协议可能是无效的或可撤销的。员工有权向法院或仲裁机构申请确认协议无效或撤销协议。
法律后果：在协议无效或被撤销的情况下，员工与用人单位之间的关系将恢复至变更前的状态，即劳务关系。用人单位需承担相应的法律责任，如支付劳务报酬、赔偿损失等。
三、特殊情况：名为合作实为劳务
实质判断：有时候，用人单位可能会通过变更合同名称的方式，试图改变与员工之间的法律关系。然而，法律关系的判断并非仅依据合同名称，而是依据合同内容、双方的实际履行情况以及法律关系的本质特征。如果合作协议的实质内容仍然是劳务关系，那么即使合同名称变更为合作协议，双方之间的法律关系仍然可能被认定为劳务关系。
法律后果：在这种情况下，如果用人单位试图通过变更合同名称来规避法律责任（如逃避支付社会保险、经济补偿等），那么这种行为可能是违法的。员工有权向相关部门投诉或提起诉讼，维护自己的合法权益。
四、建议与风险提示
谨慎签署：对于员工而言，在签署任何协议之前，都应仔细阅读协议内容，了解自己的权利义务及法律后果。如有疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师或法律机构。
保留证据：在签署协议过程中，员工应保留好相关证据（如协议文本、签署过程记录等），以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
及时维权：如果员工认为自己的合法权益受到侵害，应及时向相关部门投诉或提起诉讼，维护自己的合法权益。
如果您在劳务合同或合作协议方面遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。