结论：您可以起诉离婚并争取孩子的抚养权，但能否成功离婚以及获得抚养权，需要结合具体证据和法律规定来判断。以下从起诉离婚和抚养权争取两个角度为您详细分析：
一、关于起诉离婚
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
- 特别地，如果因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。
您的情形分析：
- 您提到妻子已经两年未与您同居，这可能构成因感情不和分居满二年的情形。如果这一事实能够得到证实，且调解无效，法院应当准予离婚。
- 但需要注意的是，分居的原因必须是感情不和，而非因工作、学习等原因导致的暂时分居。因此，您需要收集相关证据来证明分居是由于感情不和导致的。
建议：
- 收集能够证明因感情不和分居满二年的证据，如租房合同、水电费缴纳记录、邻居证言等。
- 在提起离婚诉讼前，可以尝试与妻子进行调解，看是否能够达成离婚协议。如果调解无果，再向法院提起诉讼。
二、关于争取孩子抚养权
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条的规定，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
- 离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
您的情形分析：
- 孩子目前两岁，根据法律规定，原则上由母亲直接抚养。但如果您能够证明母亲存在不利于孩子成长的情形（如虐待、遗弃、患有严重疾病等），或者您能够提供更好的抚养条件（如稳定的生活环境、更好的教育资源等），您也有可能获得孩子的抚养权。
- 另外，如果母亲同意由您抚养孩子，或者双方能够就抚养问题达成协议，那么您也可以获得孩子的抚养权。
建议：
- 收集能够证明您更适合抚养孩子的证据，如您的收入证明、居住条件证明、教育背景证明等。
- 如果可能的话，与妻子进行协商，看是否能够就抚养问题达成一致意见。如果协商无果，再在离婚诉讼中由法院根据双方的具体情况判决。
总结与进一步行动建议：
- 您有权起诉离婚并争取孩子的抚养权，但具体结果需要结合证据和法律规定来判断。
- 在提起诉讼前，建议您收集相关证据，并尝试与妻子进行调解或协商。
- 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。