当检察院在庭审中当庭提交新证据时，律师应采取以下措施来保障当事人的合法权益：

1. 立即审查新证据：

   • 律师应迅速而仔细地审查检察院提交的新证据，包括证据的来源、真实性、合法性以及与案件事实的关联性。
   • 评估新证据对案件走向和当事人权益的可能影响，以便及时调整辩护策略。

2. 提出异议或申请延期审理：

   • 如果律师认为新证据的提交违反了法定程序，如未在举证期限内提交，或者新证据与案件事实无直接关联，可以当庭提出异议，要求法庭不予采纳。
   • 若新证据的提交导致案件事实发生重大变化，且律师需要更多时间来准备应对，可以申请法庭延期审理，以便有充分的时间对新证据进行研究和准备。

3. 要求质证机会：

   • 律师应坚决要求法庭给予对新证据进行质证的机会，这是律师行使辩护权的重要环节。
   • 在质证过程中，律师可以就新证据的真实性、合法性、关联性以及证明力等方面提出质疑，并可以要求提供新证据的证人出庭作证或进行其他必要的调查。

4. 调整辩护策略：

   • 根据新证据的内容和影响，律师应及时调整辩护策略，以更好地维护当事人的合法权益。
   • 如果新证据对当事人不利，律师应积极寻找反驳证据或理由，以削弱新证据的证明力；如果新证据对当事人有利，律师则应充分利用这一机会，加强辩护力度。

5. 记录并保存相关证据材料：

   • 律师应详细记录新证据的提交情况、质证过程以及法庭的裁决结果，以便后续可能的上诉或申诉。
   • 同时，律师应妥善保存所有与新证据相关的材料，包括复印件、照片、录音录像等，以备不时之需。

在面对检察院当庭提交新证据的情况时，律师应保持冷静、迅速反应，并采取上述措施来保障当事人的合法权益。 如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。