针对您提出的“民间借贷案中借款人支付了超过法律规定的利息该怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律对民间借贷利率的限制
首先，我们需要明确法律对民间借贷利率的明确规定。根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，禁止高利放贷，借款的利率不得违反国家有关规定。具体来说，以中国人民银行授权全国银行间同业拆借中心每月20日发布的一年期贷款市场报价利率（LPR）的4倍为标准，确定民间借贷利率的司法保护上限。例如，若某时期一年期LPR为3.65%，则民间借贷年利率司法保护上限为14.6%（3.65%×4）。
二、超出法定利率部分的处理原则
利息计算与核减：
- 对于已支付的利息，若实际利率超过法定上限，超出部分应冲抵本金或予以返还。例如，若借款人按年利率36%支付了利息，而法定上限为14.6%，则超出的21.4%部分需通过核算后返还给借款人，或直接抵扣借款本金。
合同效力判定：
- 若借款合同中约定的利率超过法定上限，但未超过银行同类贷款利率四倍的，属于自然债务性质。已支付的利息不予返还，但未支付部分不受法律保护，出借人无权要求借款人支付。
- 若借款合同因高利贷被认定为无效，借款人仅需返还本金及按银行同期贷款利率计算的利息。
刑事风险边界：
- 需要注意的是，若年利率超过36%且存在暴力催收等行为的，可能构成非法经营罪或催收非法债务罪。因此，在处理此类问题时，需结合具体行为判断是否触犯刑律。
三、具体操作建议
审查借款合同：
- 仔细查看合同条款，特别是关于利息的约定，确保了解具体的利率和计算方式。若发现利率超过法定上限，应立即与出借人沟通。
与出借人沟通：
- 尝试与出借人协商，看是否能够就超额利息部分达成一致，如退还、调整利率或抵扣本金等。在沟通过程中，保持冷静和理性，以达成双方都能接受的解决方案。
保留证据：
- 妥善保管所有相关证据材料，如借款合同、支付凭证、聊天记录等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
寻求法律援助：
- 若协商无果，可向法院提起诉讼，请求确认超额利息部分无效，并要求出借人退还已支付的超额利息。在诉讼过程中，建议咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保护。
四、防范非法借贷行为
最后，我想提醒您，在借款前务必仔细甄别出借人的资质和信誉，警惕“高利贷”、“套路贷”等非法借贷行为。这些行为往往伴随着高额利息和不合理的条款，容易给借款人带来沉重的经济负担和法律风险。
综上所述，处理超过法定利息的借款问题需要遵循相关法律法规，并根据具体情况采取合适的处置方式。通过审查合同、与出借人沟通、保留证据和寻求法律援助等措施，您可以有效维护自己的合法权益。