关于非道路移动机械超标排放的处罚，通常是每台机械罚款五千元，而非所有超标机械一共罚款五千元。以下是对此问题的详细分析：

法律依据与处罚原则

根据《中华人民共和国大气污染防治法》的相关规定，非道路移动机械（如工程机械、农业机械等）如果排放大气污染物超过标准，将会受到相应的行政处罚。处罚的原则通常是针对每一台超标排放的机械进行单独处罚，而不是将所有超标机械合并计算罚款。

处罚的具体实施

1. 单台处罚：当非道路移动机械被检测出排放超标时，相关部门会依据法律规定，对该台机械进行处罚，罚款金额通常为五千元（具体金额可能因地区或具体法规而有所差异，但一般是以单台为计算单位）。

2. 多台处罚：如果有多台非道路移动机械同时超标排放，那么每台机械都将受到五千元的罚款，而不是将所有机械的罚款合并计算。例如，如果有三台机械超标，那么总罚款将是三台机械各自罚款的总和，即一万五千元。

可能的例外情况

虽然一般情况下是每台机械单独处罚，但也可能存在某些特殊情况或地方性法规，对处罚方式有所调整。然而，在没有具体法规或政策依据的情况下，我们应遵循一般原则，即每台超标机械单独接受处罚。

法律建议

1. 合规使用：为了避免不必要的法律风险和罚款，建议使用非道路移动机械的单位或个人，确保机械排放符合相关标准，定期进行维护和检测。

2. 了解法规：由于不同地区可能存在细微的法规差异，建议在使用非道路移动机械前，先了解当地的具体法规和政策要求。

3. 及时整改：如果机械被检测出排放超标，应立即停止使用，并进行整改，以避免进一步的法律后果。

如果您在非道路移动机械的使用或管理过程中遇到任何法律问题，或者对相关法规有任何疑问，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。