多开百分之三的发票是否违法需分情况讨论，具体如下：

1. 若多开发票金额对应真实交易，但税率适用错误
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。若交易真实存在，但因税率选择错误导致多开3%的发票（例如本应适用6%税率却按3%开具），属于未按规定开具发票的违法行为。税务机关可责令改正，并处1万元以下罚款；若存在偷逃税款情形，还可能涉及补缴税款、滞纳金及罚款。

2. 若多开发票金额无真实交易背景（虚开发票）
   根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；虚开税款数额较大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
   即使多开的3%属于小额，若被认定为“为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开”中的任一情形，均构成刑事犯罪。例如，企业为套取资金或增加成本，虚构交易开具发票，即使税率正确，也属于违法行为。

3. 特殊情形：善意取得虚开发票
   若受票方不知情且符合“善意取得”条件（如交易真实、支付对价、发票来源合法等），根据《国家税务总局关于纳税人善意取得虚开的增值税专用发票处理问题的通知》，受票方可能仅需补缴税款，而不承担刑事责任。但开票方仍需承担虚开发票的法律责任。

建议：

• 企业应严格审核交易真实性，确保发票内容与实际业务一致；
  
• 若发现发票开具错误，应及时作废或红冲，避免税务风险；
  
• 涉及虚开发票嫌疑时，立即配合税务机关调查，主动纠正违法行为。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料提供针对性分析。