关于“二千损失员工怎么赔偿”的问题，核心在于明确损失的性质、责任主体及赔偿依据。以下是具体分析：

1. 若损失为员工过错导致
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因员工本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
   示例：若员工因重大过失导致公司损失2000元，公司可与其协商赔偿，但若员工月工资为5000元，则每月最多扣除1000元（20%），分2个月扣完；若月工资为3000元，则每月最多扣除600元，剩余损失需通过其他方式协商或诉讼解决。

2. 若损失为用人单位原因导致
   若损失由用人单位自身管理不善、设备故障等非员工过错造成，则员工无需赔偿。例如，公司未提供安全防护措施导致员工操作失误产生损失，责任应由公司承担。

3. 若损失涉及第三方侵权
   若损失由第三方（如客户、供应商）造成，员工无过错时，公司应向第三方追偿，而非要求员工赔偿。例如，客户故意损坏公司财物导致2000元损失，公司应通过民事诉讼向客户主张权利。

4. 劳动合同或规章制度有特殊约定
   若劳动合同或公司规章制度明确约定了损失赔偿条款（如“员工违规操作需全额赔偿”），需审查条款合法性：

   • 条款不得违反《劳动合同法》第二十六条（如免除用人单位法定责任、排除劳动者权利）；
     
   • 赔偿金额需合理，不得显失公平（如要求员工赔偿超出其过错程度的损失）。
     示例：若公司规章制度规定“员工轻微过失需赔偿全部损失”，该条款可能因显失公平被认定无效。

建议行动步骤：

1. 核实损失原因及责任主体（是员工过错、公司责任还是第三方侵权）；
   
2. 检查劳动合同、规章制度中关于损失赔偿的条款是否合法有效；
   
3. 根据责任比例协商赔偿金额，或通过劳动仲裁、诉讼解决争议。
   

如有进一步细节（如损失类型、员工岗位、合同条款等），可向我补充说明，我会为您具体分析。