结论：建设工程分包施工公司若仅有营业执照而无资质证书，在发生安全事故时，确实需要承担相应的安全责任。这一责任不仅可能涉及行政处罚，还可能包括民事赔偿，甚至在特定情况下需承担刑事责任。以下从多个角度进行详细分析：
一、行政责任角度
根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，从事建筑活动的建筑施工企业、勘察单位、设计单位和工程监理单位，必须具备相应的资质条件，并在其资质等级许可的范围内从事建筑活动。若分包施工公司未取得相应资质证书而擅自承接工程，将面临行政处罚，包括但不限于责令改正、没收违法所得、罚款等。在发生安全事故时，这种违法行为更可能成为加重处罚的理由。
二、民事责任角度
合同效力问题：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的合同无效。若分包施工公司因无资质证书而导致分包合同无效，那么在发生安全事故时，该公司可能因合同无效而无法依据合同条款来免除或减轻其责任。
侵权责任：在安全事故中，若分包施工公司的行为（如施工不当、管理不善等）直接导致了事故的发生或损失的扩大，那么该公司将构成侵权，需承担相应的民事赔偿责任。这种责任可能包括赔偿受害人的医疗费、误工费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等。
三、刑事责任角度
在特定情况下，若分包施工公司的违法行为（如无资质施工、违规操作等）导致了重大安全事故的发生，且情节严重，那么该公司及其相关责任人员可能构成犯罪，需承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，这可能涉及重大责任事故罪、工程重大安全事故罪等罪名。
四、实际案例与法律后果
在实际操作中，已有多个案例表明，无资质证书的分包施工公司在发生安全事故后，不仅面临了行政处罚和民事赔偿，还有相关责任人员被追究了刑事责任。这些案例充分说明了无资质施工的法律风险和后果。
五、建议与措施
严格审查资质：总承包单位在选择分包施工公司时，应严格审查其资质证书和安全生产条件，确保分包施工公司具备相应的施工能力和安全管理水平。
加强安全管理：分包施工公司应建立健全安全生产管理制度，加强施工现场的安全管理，确保施工活动的安全进行。
及时咨询法律：若对资质要求或安全管理存在疑问，建议及时咨询专业律师或相关机构，以避免法律风险。
综上所述，建设工程分包施工公司若仅有营业执照而无资质证书，在发生安全事故时确实需要承担相应的安全责任。因此，建议各施工公司在承接工程前务必确保具备相应的资质条件，并加强安全管理，以避免不必要的法律风险。若您有任何关于建设工程或医疗纠纷、合同纠纷方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。