针对“实为合作投资款却以买卖合同起诉，法院会如何判决”的问题，结论需视具体情况而定，但核心在于法院会依据实际法律关系进行审理和判决。以下从不同角度进行详细分析：

1. 法律关系的认定：

   • 法院在审理案件时，首要任务是确定当事人之间的真实法律关系。如果双方实际为合作投资关系，但一方以买卖合同为由提起诉讼，法院会通过审查合同内容、双方的实际行为、资金往来、利润分配等证据，来认定真实的法律关系。
   • 若证据充分证明双方为合作投资关系，而非买卖合同关系，法院将依据合作投资的相关法律规定进行审理，而非买卖合同的相关规定。

2. 可能的判决结果：

   • 驳回起诉或诉讼请求：如果法院认定双方为合作投资关系，而原告以买卖合同为由起诉，且无法提供充分证据证明买卖合同关系的存在，法院可能会驳回原告的起诉或诉讼请求。
   • 按合作投资关系审理：若法院认定双方为合作投资关系，将依据合作投资的相关法律规定，如《中华人民共和国合伙企业法》等，对案件进行审理。这可能涉及投资款的返还、利润分配、亏损承担等问题。
   • 调解或和解：在诉讼过程中，双方也可能在法院的主持下进行调解或达成和解，以解决纠纷。调解或和解的结果将取决于双方的协商和妥协。

3. 法律建议：

   • 收集证据：对于被告而言，应积极收集证据，证明双方实际为合作投资关系，而非买卖合同关系。这可能包括合作协议、资金往来记录、利润分配记录等。
   • 明确诉讼请求：对于原告而言，如果确实存在合作投资关系，但误以买卖合同为由起诉，应及时调整诉讼请求，明确基于合作投资关系提出的诉求。
   • 寻求专业法律帮助：由于法律关系的认定和诉讼策略的制定需要专业的法律知识，建议双方在诉讼过程中寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保障。

4. 可能的法律后果：

   • 如果法院最终认定双方为合作投资关系，并依据相关法律规定进行判决，双方需按照判决结果履行义务。如一方不履行判决，另一方可以申请法院强制执行。
   • 若因证据不足或法律关系认定错误导致判决不利，一方可能面临经济损失或法律责任。因此，在诉讼过程中，证据的收集和法律关系的准确认定至关重要。

总结来说，法院在审理此类案件时，会依据实际法律关系进行审理和判决。如果双方实际为合作投资关系，但一方以买卖合同为由起诉，法院将通过审查证据来认定真实法律关系，并据此进行判决。因此，建议双方在诉讼过程中积极收集证据、明确诉讼请求，并寻求专业法律帮助，以确保自身权益得到充分保障。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。