已经办理离职手续的劳动者，仍然有权申请劳动仲裁。这一结论基于以下法律背景和详细分析：

一、法律背景与依据

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，因除名、辞退和辞职、离职发生的争议等，均属于劳动仲裁的受案范围。这意味着，无论劳动者是否已经办理离职手续，只要其与用人单位之间存在劳动争议，且该争议属于劳动仲裁的受理范围，劳动者均有权依法申请劳动仲裁。

二、已办理离职手续后申请劳动仲裁的适用情形

1. 离职补偿争议：劳动者在离职后，若认为用人单位未按照法律规定或劳动合同约定支付经济补偿金、赔偿金等，可以申请劳动仲裁以维护自身权益。
2. 工资结算争议：若劳动者在离职后发现用人单位存在拖欠工资、克扣工资等情形，同样可以申请劳动仲裁要求用人单位支付应得的劳动报酬。
3. 其他劳动争议：除了离职补偿和工资结算外，劳动者与用人单位之间因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护等发生的争议，也均属于劳动仲裁的受理范围。

三、申请劳动仲裁的准备与注意事项

1. 证据准备：劳动者在申请劳动仲裁时，应提供与争议有关的证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、工作证、与用人单位沟通相关争议事项的聊天记录或邮件等。这些证据有助于支持劳动者的仲裁请求，提高胜诉率。
2. 程序遵守：劳动者应了解并遵守劳动仲裁的相关程序和规定，确保自己的仲裁请求能够得到依法公正的处理。这包括按时提交仲裁申请书、参与仲裁庭审、遵守仲裁庭的纪律等。
3. 时效注意：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者在离职后应及时申请仲裁，以避免超过时效期而丧失胜诉权。

四、已办理离职手续后申请劳动仲裁的法律后果

1. 维护合法权益：通过申请劳动仲裁，劳动者可以依法维护自己的合法权益，如获得应得的经济补偿金、赔偿金或劳动报酬等。
2. 可能影响与原用人单位的关系：虽然申请劳动仲裁是劳动者的合法权利，但可能会在一定程度上影响劳动者与原用人单位之间的关系。然而，这并不应成为劳动者放弃维权的原因，因为维护自身合法权益是劳动者的基本权利。

五、具体建议

1. 全面收集证据：在申请劳动仲裁前，劳动者应尽可能全面地收集与争议有关的证据材料，以确保自己的仲裁请求能够得到充分支持。
2. 咨询专业律师：对于不熟悉劳动仲裁流程或相关法律规定的劳动者，建议咨询专业的律师以获取详细的指导和帮助。律师可以根据劳动者的具体情况提供针对性的法律建议，帮助劳动者准备充分的证据材料，并确保仲裁申请的顺利进行。

综上所述，已经办理离职手续的劳动者仍然有权申请劳动仲裁以维护自身合法权益。在申请过程中，劳动者应准备充分的证据材料、遵守相关程序和规定，并注意仲裁时效的问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。